Simbiology应用程序
交互式应用程序,以促进构建,模拟和分析动态系统
Simbiology提供了一组集成应用程序,旨在促进诸如定量系统药理学(QSP),药代动力学/药效学(PK/PD)和系统生物学模型等动态系统(QSP)等动态系统模型的模型。
这Simbiology Model Builder应用程序使您可以使用各种建模元素进行交互式构建动态模型。例如,您可以建模各种生物系统,例如信号通路,代谢网络,PBPK,QSP和PK/PD模型。它还使您可以对生物学变异性和不同的给药方案进行建模,以研究各种实验条件和剂量策略。
这Simbiology模型分析仪应用程序使您可以对动态系统模型进行分析。您可以使用各种求解器和估算模型参数模拟模型的动态行为。为了研究系统动力学和指导实验,您可以执行灵敏度分析和参数扫描。
应用
Simbiology Model Builder | 构建QSP,PK/PD和机械系统生物学模型 |
Simbiology模型分析仪 | 分析QSP,PK/PD和机械系统生物学模型 |
职能
simbio.diagram.getBlock |
获取Simbiology图块属性 |
simbio.diagram.setBlock |
设置Simbiology图块属性 |
simbio.diagram.getline |
获取Simbiology图线属性 |
simbio.diagram.setline |
设置Simbiology图线属性 |
simbio.diagram.splitblock |
图中的分裂simbiology物种块 |
simbio.diagram.joinblock |
在图中合并Simbiology物种块的副本 |
话题
构建模型
- 创建受体配体动力学模型
此示例显示了如何使用该动力学创建和模拟的简单模型Simbiology Model Builder和Simbiology模型分析仪应用。 - 使用Simbiology模型构建器将SGLT2抑制纳入基于生理的葡萄糖胰岛素模型
通过假设化合物纳入现有的葡萄糖胰岛素模型,将钠葡萄糖共转运蛋白2(SGLT2)受体抑制。 - 复制Simbiology块
在图中构建模型时,复制和粘贴Simbiology块。 - Simbiology模型组件库
Simbiology®库是内置组件的集合,您可以用来构建和分析模型。 - Simbiology模型构建器中的消息指标图标
这Simbiology Model BuilderApp使用上下文图标来提供有关浏览器表中模型组件和块中的更多信息图表标签。 - 撤消和重做模型的变化Simbiology
您可以撤消与模型构建和配置块属性相关的REDO操作。 - Simbiology模型构建器的键盘快捷键
这Simbiology Model Builder应用程序为各种建模操作提供键盘快捷键。 - 生成Simbiology模型报告
生成包含模型信息的报告。 - 查看和运行由Simbiology模型构建器查看并生成的代码
在模型构建器应用程序中查看并运行生成的MATLAB代码,以用于模型构建操作。 - 从Excel到Simbiology模型构建器的导入和导出变体和剂量
将Excel文件保存在模型构建器应用程序中的导入和导出变体和给出剂量信息。
分析模型和数据
- 使用SimBiology模型分析仪应用程序计算NCA参数和拟合模型到PK/PD数据
通过使用非线性回归拟合实验性PKPD数据,执行非各个部门分析和校准模型参数。 - 使用SimBiology模型分析仪应用程序找到具有局部灵敏度分析的重要参数
执行灵敏度分析以找到重要的模型参数。 - 使用Simbiology模型分析仪找到具有全局灵敏度分析的重要参数
使用全局灵敏度分析程序找到重要的模型参数。 - 使用Simbiology模型分析仪应用程序与虚拟患者建模生物学变异性
生成模型参数的样本值,以表示虚拟患者并模拟以探索模型变异性。 - 使用Simbiology模型分析仪应用程序扫描给药方案
探索符合功效和毒性阈值的多种剂量量。 - 使用数据集中的剂量和变体模拟组
使用数据集的特定剂量和变体执行组仿真。 - 生成Simbiology计划结果的报告
生成包含程序分析结果的报告。 - 查看和运行程序代码由Simbiology模型分析仪生成
在命令行中查看并运行生成的程序代码。 - 百分位数
使用百分位图可视化实验数据和仿真统计。 - Simbiology模型分析仪的键盘快捷键
这Simbiology模型分析仪APP为各种分析操作提供键盘快捷键。