主要内容

高通量测序

下一代测序(NGS)数据的基因表达、转录因子和甲基化分析,包括RNA-Seq和ChIP-Seq

高通量测序方法产生大量的序列数据,需要强大的计算工具进行进一步分析。生物信息学工具箱™ 提供算法以支持下一代测序(NGS)数据的通用分析工作流,例如筛选和修剪读取、将读取映射到引用、计算映射到基因组特征的读取数以及执行统计分析。万博1manbetx

  • 数据导入
    从SAM、BAM、FASTA、FASTQ、GTF和GFF文件导入下一代测序(NGS)数据和特征注释
  • 预处理
    使用单端和成对端读取、筛选和修剪读取以及显示质量统计信息来管理NGS数据
  • 对齐
    将读取映射到引用序列
  • 统计分析
    阅读RNA序列和芯片序列数据的摘要和统计分析
  • 形象化
    可视化读取与参考序列的对齐

特色实例