gQSPSim

应用程序开发标准化的QSP模型发展

271下载

更新星期五,2021年3月05 19:12:32 + 0000

从GitHub

查看许可GitHub

gQSPSim是一个基于gui的MATLAB®应用程序,执行关键步骤QSP模型开发和分析,包括:

1)模型校准使用全局和局部优化方法
2)开发的虚拟对象代表生物学探索可变性和不确定性
3)模拟虚拟人群不同的干预措施。

gQSPSim与SimBiology®制造模型,利用组件(如物种,剂量,变体,和规则。所有的功能都配备一个交互式可视化界面和生成presentation-ready数据的能力。此外,标准化gQSPSim会话可以共享或保存为未来的扩展和重用。

源代码和案例研究中引用github帐户。gQSPSim的描述和案例研究的发表题为“gQSPSim:一个GUI应用程序基于SimBiology®标准化QSP模型开发和应用”。

产品说明:

1)安装Matlab 2018或更高版本在你的电脑上。Matlab不兼容以前版本的。

2)参见以下链接获取支持的编译器的Mac和PC用户列表(万博1manbetx//www.tianjin-qmedu.com/content/dam/mathworks/mathworks-dot-com/万博1manbetxsupport/sysreq/files/SystemRequirements-Release2018a_SupportedCompilers.pdf)
2)对于Mac用户来说,安装xcode。
•2 b) PC用户,安装一个支持的编译器(lcc-win64或MinGW 5万博1manbetx.3 C / c++或Microsoft Visual c++)

3)一旦安装编译器,打开Matlab,运行以下命令
c•墨西哥人设置
•墨西哥人设置c++

4)检查编译器已成功在你的电脑配置,运行以下命令:
•modelObj = sbmlimport(“洛特卡”);
•em =出口(modelObj)
•加快(em);
•em.isAccelerated

答案应该是1

在Windows上支持长文件名

1)启动注册表编辑器(regedit.exe)
2)导航到HKEY_LOCAL_MACHINE \ SYSTEM \ CurrentControlSet \ \文件系统控制
3)双击LongPathsEnabled
4)设置为1,然后单击OK
5)重新启动

解压缩的案例研究在Windows Zip文件

1)下载并安装7 - ziphttps://www.7-zip.org/
2)使用7 - zip解压案例研究的zip文件

gQSPSim安装:

1)打开Matlab
2)安装gQSPSim.mltbx
3)从应用程序运行gQSPSim工具栏

更新v1.1

*兼容r2018a - 2020 b
*更新案例研究
*改善并行队列生成和仿真
*提高会话的跨平台兼容性
*限制可配置数量的痕迹显示当渲染情节
*改进选择规则/反应灭活的任务
在Windows上*改万博1manbetx进支持长文件名
*包图形库依赖关系
*各种错误修复

引用作为

Iraj Hosseini (2023)。gQSPSimGitHub (https://github.com/gQSPSim/gQSPsim-release/releases/tag/v1.1)。检索

MATLAB版本兼容性
创建R2018a
与R2018a后来版本兼容
平台的兼容性
窗户 macOS Linux
社区
更多的文件SimBiology社区

社区寻宝

找到宝藏在MATLAB中央,发现社区如何帮助你!

开始狩猎!

案例研究/ CaseStudy_aPCSK9 aPCSK9_v7_MES_blank / Plotting_validation

案例研究/ CaseStudy_aPCSK9 / aPCSK9_v7_MES_blank / UDF

案例研究/ CaseStudy_aPCSK9 aPCSK9_v7_MES_complete / Plotting_validation

案例研究/ CaseStudy_aPCSK9 / aPCSK9_v7_MES_complete / UDF

版本 发表 发布说明
1.1

问题在这个视图或报告GitHub插件,参观GitHub库
问题在这个视图或报告GitHub插件,参观GitHub库