SimBiology Apps

Interactive apps to facilitate building, simulating, and analyzing dynamic systems

Simbiology提供了一组集成应用程序，旨在促进诸如定量系统药理学（QSP），药代动力学/药效学（PK/PD）和系统生物学模型等动态系统（QSP）等动态系统模型的模型。

这Simbiology Model Builder应用程序允许您构建动态模型交互ing various modeling elements. For instance, you can model a variety of biological systems such as signaling pathways, metabolic networks, PBPK, QSP, and PK/PD models. It also lets you model biological variability and different dosing regimens to investigate various experimental conditions and dosing strategies.
这Simbiology模型分析仪应用程序使您可以对动态系统模型进行分析。您可以使用各种求解器和估算模型参数模拟模型的动态行为。为了研究系统动力学和指导实验，您可以执行灵敏度分析和参数扫描。

应用

Simbiology Model Builder	Build QSP, PK/PD, and mechanistic systems biology models interactively
Simbiology模型分析仪	分析QSP，PK/PD和机械系统生物学模型

功能

`simbio.diagram.getBlock`	获取Simbiology图块属性
`simbio.diagram.setBlock`	Set SimBiology diagram block properties
`simbio.diagram.getline`	Get SimBiology diagram line properties
`simbio.diagram.setLine`	Set SimBiology diagram line properties
`simbio.diagram.splitblock`	Split SimBiology species block in diagram
`simbio.diagram.joinblock`	在图中合并Simbiology物种块的副本

话题

构建模型

创建受体配体动力学模型
This example shows how to create and simulate a simple model of receptor-ligand kinetics using theSimbiology Model BuilderandSimbiology模型分析仪应用。
Incorporate SGLT2 Inhibition into Physiologically Based Glucose-Insulin Model Using SimBiology Model Builder
通过假设化合物纳入现有的葡萄糖胰岛素模型，将钠葡萄糖共转运蛋白2（SGLT2）受体抑制。
Copy SimBiology Blocks
Copy and paste SimBiology blocks while building models in the Diagram.
SimBiology Model Component Libraries
Simbiology^®库是内置组件的集合，您可以用来构建和分析模型。
Message Indicator Icons in SimBiology Model Builder
这Simbiology Model BuilderApp使用上下文图标来提供有关浏览器表中模型组件和块中的更多信息Diagram标签。
撤消和重做模型的变化Simbiology
您可以撤消与模型构建和配置块属性相关的REDO操作。
Simbiology模型构建器的键盘快捷键
这Simbiology Model Builder应用程序为各种建模操作提供键盘快捷键。
生成Simbiology模型报告
Generate reports containing model information.
View and Run Generated Code by SimBiology Model Builder
在模型构建器应用程序中查看并运行生成的MATLAB代码，以用于模型构建操作。
从Excel到Simbiology模型构建器的导入和导出变体和剂量
将Excel文件保存在模型构建器应用程序中的导入和导出变体和给出剂量信息。

分析模型和数据

Calculate NCA Parameters and Fit Model to PK/PD Data Using SimBiology Model Analyzer App
通过使用非线性回归拟合实验性PKPD数据，执行非各个部门分析和校准模型参数。
Find Important Parameters with Local Sensitivity Analysis Using SimBiology Model Analyzer App
Perform sensitivity analysis to find important model parameters.
使用Simbiology模型分析仪找到具有全局灵敏度分析的重要参数
Find important model parameters using global sensitivity analysis program.
使用Simbiology模型分析仪应用程序与虚拟患者建模生物学变异性
生成模型参数的样本值，以表示虚拟患者并模拟以探索模型变异性。
使用Simbiology模型分析仪应用程序扫描给药方案
探索符合功效和毒性阈值的多种剂量量。
Simulate Groups Using Doses and Variants from Data Set
使用数据集的特定剂量和变体执行组仿真。
Generate Report for SimBiology Program Results
生成包含程序分析结果的报告。
查看和运行程序代码由Simbiology模型分析仪生成
在命令行中查看并运行生成的程序代码。
Percentile Plot
使用百分位图可视化实验数据和仿真统计。
Simbiology模型分析仪的键盘快捷键
这Simbiology模型分析仪APP为各种分析操作提供键盘快捷键。