SimBiology模型调试器是一个MATLAB应用程序,允许您响应分析模型,模型结构,在模型模拟和表达。
开始:
安装调试器模型对SimBiology只是doubleclick mltbx文件。可以通过单击管理安装附件附件按钮MATLAB将来发布。
开始为SimBiology类型模型调试器”startSimBiologyDebugger(模型)”模型是一个SimBiology模型。
更多信息类型如何应用剂量和变异类型“帮助startSimBiologyDebugger”在MATLAB命令行窗口中。
看到GettingStarted.mlx也。
例子:
%负荷模型
模型= sbmlimport(“洛特卡”);
%为模拟配置模型
configset = getconfigset(模型);
configset.SolverOptions。AbsoluteTolerance = 1 e-6;
configset.SolverOptions。RelativeTolerance = 1 e-6;
%定义剂量
剂量= sbiodose (y1的剂量”,“TargetName”,“日元”,“数量”,50);
%开始模型调试器为SimBiology模型和剂量
startSimBiologyDebugger(模型、剂量);
系统需求:
MATLAB R2019b或更高版本和SimBiology™工具箱是SimBiology运行模型所需调试器。
单位转换支持MATLAB R2020a万博1manbetx或更高版本。
特点:
断点暂停指定条件模型模拟。你可以检测如果物种值负或模型组件的值是南,正无穷,或复杂的。触发断点用黄色突出显示。从下拉菜单中选择一个事件调查在控制栏位于应用程序窗口的顶部。你可以禁用预定义的断点继续仿真。
对于调试可以依赖图的可视化模型组件的值是如何计算的。还可以绘制时间课程的模型反应,探索图形化表达。表达式树中的节点代表组成的表达式。节点的颜色表明南(红色),无限(橙色),复杂的(黄色),或实际值(绿色)。
定制您的偏好模型模拟和表达视图设置面板。
Florian奥古斯汀(2021)。模型调试器SimBiologyGitHub (https://github.com/MathWorks-SimBiology/ModelDebugger/releases/tag/1.0.2)。检索。