主要内容

Genpeptread

从genpept文件中读取数据

句法

genpeptdata= genpeptread(文件
genpeptdata= genpeptread(文件, '暂停',超时价值

参数

文件

以下两项:

  • 字符向量或字符串指定文件名,路径和文件名或指向文件的URL。引用文件是一个genpept-formatted文件。如果仅指定文件名,则该文件必须在MATLAB上®搜索路径或MATLAB电流文件夹。

  • MATLAB字符数组包含Genpept-Formatted文件的文本。

小费

您可以使用getGenpept功能'tofile'属性以从GenPEPT数据库中检索序列信息,并创建一个genpept-formatted文件。

超时价值 连接超时以秒为单位,指定为正标量。默认值为5。有关详细信息,请参阅这里
genpeptdata MATLAB结构或包含与Genpept关键字相对应的字段的结构数组。

描述

笔记

NCBI已将其蛋白质搜索引擎的名称从Genpept更改为Entrez蛋白质。但是,BioInformatics Toolbox™软件中的函数名称(getGenpeptGenpeptread)不变,代表仍然使用的Genpept报告格式。

genpeptdata= genpeptread(文件读取一个genpept-formatted文件,文件,创造genpeptdata,结构或结构数组,其中包含与Genpept关键字相对应的字段。什么时候文件包含多个条目,每个条目存储在genpeptdata。有关Genpept关键字列表,请参见https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sitemap/samplerecord.html

genpeptdata= genpeptread(文件, '暂停',超时价值设置连接超时(以秒为单位)以从远程文件或URL读取数据。

例子

检索由Hexa基因编码的蛋白质的序列信息,将数据存储在文件中,然后读取到MATLAB软件中。

getGenpept('p06865','tofile','taysachs_protein.txt')genpeptread('taysachs_protein.txt')

版本历史记录

在R2006a之前引入