模拟酵母异质纤维纤维蛋白循环 - MATLAB和SIMULINK万博1manbetx

模拟酵母异络蛋白循环

此示例显示如何配置模拟设置，将事件添加到模型中以触发基于时间的更改，保存和绘制模拟结果。此示例使用所描述的模型酵母异质型G蛋白质周期的模型为了说明模型模拟。

加载gprotein.sbproj.项目，包括变量M1，一种偶像生物学^®模型对象。

sbioloadproject.GPRotein.

将仿真求解器设置为ode15s.并设置停止时间500.通过编辑索尔弗蒂和停止属性Configset对象与之相关M1模型。

csobj = getConfigset（M1）;csobj.solvertype ='ode15s';csobj.stoptime = 500;

指定对所有物种的仿真结果进行指定。

csobj.runtimeOptions.statestolog =.'全部';

假设配体种类的量L.在仿真开始时是0，但它会增加到特定量= 100.使用SbioSelect.选择命名的物种L.并将其初始金额设置为0.使用addevent.设置所需的事件。

sceniSobj = SbioSelect（M1，'类型'那'物种'那'名称'那'L'）;sceniSobj.initialAmount = 0;evt = addevent（m1，'时间> = 100'那'l = 6.022e17'）;

模拟模型。

[t，x，名称] = sbiosmulate（m1）;

模拟仿真结果。请注意，当事件在模拟时间100触发事件时，物种L的量增加。由于物种量的宽范围，其他物种的变化不会显示在图中。

绘图（t，x）;传奇（名称）Xlabel（'时间'）;ylabel（'数量'）;

图包含轴。轴包含8个类型的线。这些对象代表G，GD，GA，RL，L，R，GBG，GAFRAC。

要查看其他物种的变化，则没有物种L（第5种）数据的绘图。

图绘图（t，x（：，[1：4 6：8]））;图例（名称{[1：4 6：8]}）;Xlabel（'时间'）;ylabel（'数量'）;

图包含轴。轴包含7个类型的类型。这些对象代表G，GD，GA，RL，R，GBG，GAFRAC。

在单独的输出中存储模拟数据的替代方案，例如T.那X，和名称如上所述，您可以将它们全部存储在一个辛迪塔对象。然后你可以使用SelectByName.提取包含您兴趣的模拟数据的阵列。

Simdata = Sbiosmulate（M1）;SBIOPLOT（SIMDATA）;

图包含轴。具有标题状态与时间的轴包含8个类型的类型。这些对象代表G，GD，GA，RL，L，R，GBG，GAFRAC。

扩张跑1要查看绘制的物种和参数的名称。

simdata_nol = selectbyname（Simdata，{'Ga'那'G'那'GD'那'GAFRAC'那'rl'那'r'}); sbioplot（simdata_noL）；

图包含轴。具有标题状态与时间的轴包含6个类型线的对象。这些对象代表GA，G，GD，GAFRAC，RL，R.