请始终查看nifti_tools.pdf进行详细说明和最新更新。
如果您对分析图像的左/右感到困惑,请阅读UseANALYZE.pdf。
您可能还想通过FAQ.pdf获取实用解决方案和真实示例。万博 尤文图斯
基本计划:
1.load_untouch_header_only.m:只加载NIfTI或ANALYZE文件的header部分,自动检测输入文件,NIfTI文件返回NIfTI结构,ANALYZE文件返回ANALYZE结构。
2.load_nii.m:加载N维NIfTI文件(其中N可以是3到7)或分析文件(其中N可以是3到4),并将标题信息(例如仿射几何变换、体素强度缩放等)应用于数据。如果您的文件具有3维以上(例如时间序列等),还可以指定仅提取1个或多个卷的范围。
3.save_nii.m:将由“load_nii.m”或“make_nii.m”加载的N维NIfTI结构(其中N可以是3到7)保存到NIfTI文件中。
4.make_nii.m:基于N维矩阵和其他可选参数(例如体素大小、原点等)生成N维NIfTI结构(其中N可以是3到7)。使用“save_nii”命令,可以将由“make_nii”生成的NIfTI结构保存到NIfTI文件中。
5.make_ana.m:基于3D矩阵和其他可选参数(例如体素大小、原点等)生成3D分析结构。使用“save_untouch_nii”命令,可以将“make_ana”生成的分析结构保存到分析文件中,以便与某些仅分析程序兼容。
6. Reslice_nii.m:重新示例3D(或4d)nifti文件,或分析带有仿射矩阵m的文件.mat文件,并将重新采样的数据保存到新的nifti文件中。该程序将基于仿射矩阵,这对于具有不能加载的非正交旋转或剪切的倾斜图像特别有用,这些旋转或不能加载“Load_NII.m”。您还可以指定Voxel_Size等。它不会引起负面影响,只要您记得在使用“Reslice_nii.m”后不做切片时间校正。
7.pad_nii.m:从六个面中的任意一个面填充NIfTI结构中的体积,同时保持原始体、体素大小、数据类型和描述不变。使用reslice_nii后,该程序特别有用,因为新卷很可能具有不同的维度。
8.clip_nii.m:从六个面中的任意一面剪裁NIfTI结构中的体积,同时保持原始体、体素大小、数据类型和描述不变。使用reslice_nii后,该程序特别有用,因为新卷很可能具有不同的维度。
9view_nii.m:查看和编辑3D(或4D)NIfTI或分析由“load_nii.m”加载或由“make_nii.m”制作的结构。激活图、ROI等可以覆盖在背景图像上(参见上图)。打印视图可以嵌入到现有地物窗口中。如果将其用作单个程序,它还可以编辑图像的方向和体素值,查看体积直方图,并保存修改后的图像。
10load_untouch_nii.m:加载N维NIfTI文件(其中N可以是3到7)或分析文件(其中N可以是3到4),但不应用头中指示的任何更改。警告:请勿使用“view_nii.m”查看由“load_untouch_nii.m”加载的结构。
11save_untouch_nii.m:将“load_untouch_nii.m”加载或“make_ana.m”生成的N维NIfTI结构(其中N可以是3到7)或分析结构(其中N可以是3到4)保存到新的NIfTI或分析文件中。如果不修改加载的数据集,则新保存的文件中的标题和数据应与原始文件中的标题和数据相同。
其他计划:
1.collapse\u nii\u scan.m:将多个单扫描NIfTI或分析文件集成到多扫描NIfTI文件中。
2. expand_nii_scan.m:将多扫描NIFTI文件中断到多个单扫描NIFTI文件中。
3. save_untouch_slice.m:保存回原始图像,其中包含由load_untouch_nii加载的一部分切片。只要没有更改它们的维度,您可以以任何方式处理这些切片矩阵。
4.get_nii_frame.m:返回NIfTI文件的时间帧数。
5.flip_lr.m:沿发起人所在平面左右翻转NIfTI或分析文件,并将L-R翻转的数据保存到NIfTI文件中。警告:请小心使用此程序,尽管您可以随时将其翻转回来。
6.load_nii_ext.m:从NIfTI文件加载头扩展名。
7.mat_into_hdr.m:将旧SPM.mat文件中的仿射矩阵集成到其.hdr头文件中。因此,分析文件被转换为具有更新的.hdr头文件的NIfTI文件。
引用
吉米沉(2021)。nifti和分析图像的工具(//www.tianjin-qmedu.com/matlabcentral/fileexchange/8797-tools-for-nifti-ananalyze-image),Matlab中央文件交换。检索到.
MATLAB版本兼容性
平台兼容性
窗户 马科斯 Linux标签
致谢
灵感来自:MRI分析工具
启发:PCG_展开_2D(ph_nii、ph_文件、掩模_nii、max_iter、epsi_con、N),MRIqual,生物图像套件网站,ExportPngInkscape(文件名、dpi、句柄),用于MRI数据的参数映射脚本,fMRIData工具,NIfTI工作室,多模态体分割的可视化,西门子DICOM分拣和转换为NIfTI,双极彩色地图,生成合成FMRI数据,快速:用于扩散成像的常规保证管道,三维NIfTI数据查看器,几秒钟到几小时,分钟,秒,合成图像,创建mosaic.m,字段映射工具箱,查看MRI切片的功能,要加载和查看的GUI .NII文件。,DICOM到NIFI转换器,使用逐步聚类在大脑FMRI数据中找到功能网络,脑尺