Bioinformatics工具箱
对基因组和蛋白质组进行可视化分析
Bioinformatics Toolbox™Contiene Algoritmi E APP每IL Shequenziamento di Nuova Generazione（NGS，下一代测序），L'Analisi di MicroArray，La Spettrometria di Massa E L'Ontologia Genica。Grazie Alle Funzioni del Toolbox，è可能leggere dati genomici exceomici da formati文件标准sam，fasta，cel e cdf，oltre che da data database在线来到Il Gene表达omnibus dell'ncbi e Genbank®. È在序列图中，在calore spaziali e clustergram的地图中，可能会出现可视化问题。在皮奇市的技术统计局，瓦洛里市的自然资源中心是一个特色城市。
Positibile Combinare Le Funzioni del Toolbox Per S万博1manbetxhiteSare Flussi di Lavoro di Bioinformaticapiùdiffusi。èCosibibleUSARE Dati Chip-SEQ每个人I Fattori di Trascrizione;Analizzare I Dati RNA-SEQ每个人I Geni Interprisemente浓咖啡;Trovare Le Varianti Del Numero di Copie E在Dati di MicroArray中的Gli SNP;Classificare I Profili Delle Proteine usando dati di spettrometria di massa。
马吉奥利·因莫西奥尼·苏拉计算机生物学。
乌拉岛：
生物信息学工具箱提供新一代生物分析的算法和技术(NGS)。我的工具箱一致同意进行基因组间的分析。È可能的usare il browser NGS per visualizzare e studiare gli allineamenti delle read corte usando read corte di tipo single-end or paired-end。È anche可能的服装套路分析个性化，来说明忽略esempi che guono。
visual zione e studio dell 'allineamento delle reads corte
我们可以通过浏览NGS， è来验证我们的研究，我们可以对基因序列进行分析，我们可以对基因序列进行分析。万博1manbetxIl浏览器NGS同意di:
- Visualizzare dati di读取Corte Allineati A Una Sequenza di Riferimento Nucleotidica
- 在所有冲突中，对抗都是以不同的方式进行的
- 想象不同的基础区域和不同的序列
- 研究大蒜的质量
- 个人在政治基础上的错误分类
- 视觉化eliminazioni
- Recuperare annotazioni迪功能相对于UNA大区的specifica德拉SEQUENZA迪riferimento
浏览器NGS，在Cui Vengono Illustrati dei Polimorfismi在Gransetto中的单晶核苷酸（SNP）。èChissibileVisualizzare不同的Tracciati di Dati，esaminare我picchi，个人格雷尼·伊斯特利斯e le eliminazioni e studiasrelaqualitàdelle读书。
ConservazioneèGESTIONE代DATI阿尔sequenze二读科尔特
我根据《金融记忆》的《新一代金融分析》设定了数据效用。生物信息学工具箱提供了一份关于基因内部分析的同意书。
L'oggetto生物indexedfile.同意在测试中加入所有内容或文件，且内容和尺寸不一致的情况下，按照数据集的顺序、注释和检验。任务Oggeti possono essere生成一份表格，平面文件，格式特定，根据确定的应用程序。SAM，FASTA e FASTQ。
内拉·克拉斯BioMap我们可以将所有的信息顺序读给corte，将所有的信息顺序读给corte，将所有的信息顺序读给qualità，将所有的信息顺序读给qualità，将所有的信息顺序读给真主安拉，将所有的信息顺序读给真主安拉，将所有的信息顺序读给È可能的效用proprietà di oggetti e metodi per esplorare, accedere，滤镜e manipolare i dati contenuti in un oggetto BioMap。
Normalizzazione di微阵列
èConsibibileUSARE Diversi Metodi Per Qualizzare I Dati Di Microarray，ComplosaLacomenizzazione Lowess，Della Media Globale，Della Deviazione Mediana Assoluta（Mad）e La Normalizzazione Stime。Questi Metodi Possone Essere Applati All'Intero Chip Del MicroArray O区域o Blocchi特定。Le Funzioni di Filtraggio E Stationuzione Consenterono di ulire i dati grezzi prima di eseSuire le Analisi e Le rustine divestiveizzione。
数据可视化分析
生物信息工具箱consente二eseguire regolazioni德尔背景E双链calcolare我valori二espressione DEI GENI（集合二探空仪）一个partire岱DATI一个livello二雄达二微阵列的Affymetrix®鲁棒多阵列平均(RMA)和GC鲁棒多阵列平均(GCRMA)。È可能的应用是一个节段的圆形的数据阵列- cgh e stimare il tasso di falsa scoperta di più test di ipotesi dei dati di意式数据阵列和一个部分的精子微阵列。在più， è可能eseguire la normalizzazione a rango invariante sulle intensità delle sonde per più文件CEL Affymetrix o sui valori di espressione de geni a partire due condizioni sperimenti diverse。
Le常规专业专长每拉宫桂节dei dati dei microarray comand comono i火山图，i broadloplot，i grafici log-log，i grafici i-r e le mappe di Calore spaziali del microarray。èChePossibileVisualizzareDilegli Idegography Con Pattern Di G-anding。
我的例行公事统计和机器学习工具箱™例如，可能的分类法、聚类法、K-均值法、可视化统计中的基因芯片数据表示法、聚类图2D比对法、calore地图、主成分分析法和分类法。
基因表达谱中的火山图。
生物信息工具箱offre联合国一套双funzioni每L'analisi代DATI迪spettrometria迪马萨。Queste funzioni consentono二预elaborare，classificareÈidentificare我marcatori哒DATI SELDI，MALDI，LC / MSëGC / MS。勒funzioni二预elaborazione comprendono LA correzione，啦linearizzazione，LA calibrazioneÈIL ricampionamento DEI DATI二基。Èanche不可能性allineare我DATI德利阿布鲁spettri grezzi山岛L'ASSE M / Zëprocedere all'allineamento德尔节奏二ritenzioneスDATI LC / MSëGC / MS。È不可能性eseguire IL plottaggio迪彪spettri contemporaneamente。
GLI spettri possono essere linearizzati，allineatiēnormalizzati。POI，感恩教堂的Agli工具类迪classificazioneēapprendimento statistico，SI possono creare代classificatoriËindividuare代potenziali biomarcatori。
analisi metabolomica e proteomica不同endiale senza Etichette Con Bioinformatics工具箱。
Teoria代grafiËvisualizzazione
生物信息学工具箱同意将grafi基础应用于矩阵稀疏。È可能的creare，可视化的grafi和manipolare grafi come le mappe di interazione，i grafici gerarchi i pathway。在确定是否符合格拉菲标准的视觉化和渗透性的仪器上，验证是否符合格拉菲标准。
Apprendimimeno Statistico E Visualizzione
生物信息工具箱offre funzioni车operano sugli algoritmi迪classificazioneËapprendimento statistico迪统计和机器学习工具箱，崔茶：
- Classificatori支万博1manbetx持向量机（SVM）e K-Interlight邻居
- 每个组织都进行了交叉验证，以确定是否有不同的分类
- 根据选择功能的跨部门仪器，地图和视觉化grafici Gerarchi路径
视觉化统计。
Ontologia杰妮卡
生物信息学工具箱permette di Concere al数据库del progetto Gene Ontology da MATLAB®，di analizzare i文件安宁蒂迪纳洛洛世Genica e di Ottienere dei sottogruppi dell'ontologia来到Gli Antenati，我Discendenti o我hentri。
Allineamento di sequenze
我的工具箱里有一个funzioni的配置，可以对序列进行分析，对一个副本进行综合的序列，对序列进行多重的分析。园子温compresi:
- 实施MATLAB di算法标准，以满足全球各地的需求，包括Needleman Wunsch的l'algoritmo、Smith Waterman e quello del modello nascosto di Markov
- 对多个进行性序列进行排序
- 我画了一幅画，画了一个轮廓线
- 标准基质，来自于基质PAM e BLOSUM家族
- Calcolo Delle Sequenze Consenso E Visualizzione del Logo Della Shequenza
埃斯普洛拉广场（伊马基尼3号）
Statisticheè效用相对全部sequenze
我的工具箱同意分析每个理解的正确序列。E的可行性:
- Convertire sequenze二DNAöRNA在sequenze二amminoacidi山岛IL codice genetico
- 对特定的尾蚴模式进行统计分析和序列分析
- 根据casi di试验，在硅片序列或硅片序列中使用酶限制和蛋白质
- prevedere la struttura secondaria con il minimo dell'energia libera delle sendenze di Rna
Visualizzazione delle sequenze
工具库同意对所有序列进行可视化。工具库可能对序列进行线性或环形标注。工具库可能对RNA序列进行二次可视化。工具库可能对所有序列进行可视化昆兹：我要一个铜币。
analisi di Alberi丝瘤
我的工具箱一致认为我是阿尔贝丝状体。È可能的calcolare le distance tra le coppie, tra sequize di nucleotidi o aminoacidi allineate o meno, usando un ' amia gamma di metriche di iglianza, come Jukes-Cantor, p-distance, alignment-score o altro metodo definito dall 'utente。Unweighted Pair Group Method, UPGMA (Unweighted Pair Group Method, Unweighted Pair Group Method, Unweighted Pair Group Method, UPGMA)。
工具箱支持计算比索和阿万博1manbetx尔贝里半径，计算子树和规范形式。在波塔雷同意的丝状纤维形成术的可视化仪器中，有一台是riordinare e rinominare i rami；esplorare le distanze；leggere o scrivere文件格式为di Newick。根据目前的情况，在MATLAB中显示gli仪器的可能性。
analisi delle carateristiche delle proteine
IL Toolbox Offre Tecniche Per Analizzare Le Sendenze di Proteine，Compres Perle常规Per IL CalcoloProprietàdiUna Sequenza di Peptidi来La Composizione Dell'atomo，Il Punto Isoelettrico E IL PESO Sollarare。è可能确定洛杉矶Composizione Degli Amminoacidi Delle Sequenze Di Proteine，Scindere Una Proteina Con Un Enzima E Craree Graficii Del骨架E Grafici di Ramachandran di Dati Pdb。è可能usare inl序列工具per vedere leproprietàdi una sequenza di Amminoacidi o Il分子观众每个Visualizzare e Manipolare Strutture Sollatulari 3D。
文件访问数据库的格式
È possible accedere a formati file standard per I dati biologici, a database online e a siti web。生物信息学工具箱同意di:
- Leggere我DATI阿尔sequenze达formati文件标准来FASTA，PDBēSCF
- Leggere I Dati Dei MicroArray D Formati文件来我文件Affymetrix DAT，EXP，CEL，CHP E CDF;Dati di Risultati Imagene®；文件安捷伦®特征提取软件;文件GenePix®探地雷达
- Leggere I Dati da数据库在线来到Genbank，Embl，NCBI Blast E PDB
- 基因表达的重要数据综合性数据
- Leggere客房信息BANDE citogenetiche dagli ideogrammi dell'NCBIØ大appositi文件迪德图dell'UCSC
- 马萨诸塞州斯佩特罗梅里亚的Leggere dai文件MZXML e JCAMP-DX
条件是分配应用的算法
MATLAB提供了在应用软件个性化中对数据进行程序分析的工具。在使用界面的时候，我们不能使用压缩的乐器，也不能使用集成的乐器和分析器。I prodotti per la distribuzione delle applicazioni MATLAB consentono di integrare I propri algoritmi MATLAB concodice C, c++ e applicazioni Java™esistenti, di distribuire gli algoritmi svilupati e interface personalizate come applicazioni standalone, di convertire gli algoritmi MATLAB in componenti Microsoft®.Net o com a cui sipuòachaceraqualsiasi应用程序苏基com e di crahe加载项di microsoft Excel®。
è可以整容Matlab Con Gli Strumenti di BioinformaticaPiùUSATI来生物培养器，I Servizi Web Basati Su Soap E I插入COM。
Condivisione di Algoritmi E Distribuzione Di Applicazioni。
