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生物系统中荧光信号共域和定量的MATLAB图像处理
Matloob Khushi,儿童医学研究所
儿童医学研究所(CMRI)是澳大利亚第一个专门的儿科医学研究机构,57年来一直帮助拯救儿童的生命。在CMRI中,荧光显微镜通常被用于可视化蛋白质,DNA和细胞结构标记不同的荧光团。在合成的图像中分析不同通道之间的信号重叠程度,这可作为荧光团标记的生物实体共域化的一种测量方法。研究人员正在手动执行这种协同化工作,这既耗时又繁琐,而且容易出现人为错误。
使用图像处理工具箱™,他们开发了一种新的方法来自动识别两个通道上的荧光信号区域,识别这些区域的共定位部分,并计算共定位的统计显著性。使用GUIDE,开发了一个用户界面来可视化信号共域,并为共域分析调整用户定义的参数,包括应用中值或维纳滤波来提高信噪比。命令行执行允许批处理多个图像。用户还可以使用学生t检验计算观察到的信号共域与随机重叠的统计显著性。我们的验证揭示了人工和自动识别共定位之间高度显著的相关性。因此,我们的自动方法有能力取代人工共域计数,并有潜力应用于广泛的生物领域。
记录:2016年5月24日
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