生物信息学的工具箱
丽亚,请查看genómicos y proteómicos
Bioinformatics Toolbox™proporciona algoritmos y apps para secuenciación de próxima generación (NGS), análisis de microarrays, espectrometría de masas y ontología genética。Las funciones de esta toolbox permiten leer datos genómicos y proteómicos en formatos de archivo estándar como SAM, FASTA, CEL y CDF, así como en base de datos online tales como Gene Expression Omnibus y GenBank®del NCBI.探索和可视化的estos datos con navegadores de secuencias,mapas de calor espaciales y clustergramas.工具箱中的también Protociona técnicas estadís a picos,Puptar valores a datos ausentes y Seleccial caracterís。
工具箱的功能与常规生物信息系统的实用性相结合。有可能使用datos芯片序列识别转录因子,分析datos RNA序列识别基因表达差异,识别基因拷贝和基因芯片SNP中的变异,以及使用蛋白质和特定数据进行分类。
索布雷大学信息学院生物计算机.
Mas给:
生物信息学工具箱Propicona algoritmos y técnicas de visualización para elálisis de secuenciación de próxima generación。ESTA工具箱。公共设施和非公共设施研究机构的公共设施研究机构的公共设施研究机构的公共设施研究机构的公共设施研究机构的公共设施研究机构的公共设施研究机构的公共设施研究机构的公共设施研究机构的公共设施研究机构的公共设施研究机构的公共设施研究机构的公共设施研究机构的公共设施研究机构的公共设施研究机构的公共设施研究机构的公共设施研究机构的公共设施研究机构的公共设施研究机构。这是一种个性化的生活方式,它可以让你的生活变得更加美好。
可视化cortas讲师团队调查
navegador允许研究人员对发电厂和发电厂的变化和排放进行评估。El navegador NGS también permite:
- 关于核参考文献的可视化数据
- 比较我们的合意语和参考语的合意语común
- 在不同的基础上有不同的参照区域
- calidad和otros研究所讲师
- 同一性差异与多聚性碱基的误差相同
- 可视化插入物和eliminaciones
- 为características的亲属恢复一个región específica的参考文献
科尔塔斯讲师学院
这是普罗西马总工会在纪念西卡大教堂举行的一次会议上利用数据的机会。生物信息学工具箱Propicona Contendores de datos Specializados que permiten analizar genomas completos。
El objetoBioIndexedFile
文件档案的许可证继承人包括不穿制服的塔玛诺人、秘密故事、秘密故事和参考资料。一般性的目标是一份表格、一份计划和一份特别的应用程序、一个故事、一个故事和一个故事。
拉克拉斯BioMap
科尔塔斯讲座的信息,包括讲座的内容、讲座的内容、课程的内容和参考资料。在生物地图中,勘探、加入、过滤和管理目标的实用性和准确性。
正常化Ación de微阵列
在微阵列数据的规范化方面,公共事业部门、地方媒体、全球媒体、绝对媒体(DMA)和标准化部门都有自己的经验。可能的应用包括:基因芯片、基因区域、基因块等。过滤和输入功能允许在视觉化和视觉化过程中使用。
达托斯的视觉化
生物信息学工具箱允许实现对expresión génica的valores的计算(与sondas的结合)和microarray Affymetrix的sonda的数据的部分调整®多阵列鲁棒性(RMA)和多阵列鲁棒性(GCRMA)。可以适用于segmentación二进制循环的阵列的数据,也可以应用于hipótesis和expresión génica的微阵列的实验。También se normalize conjuntos con rangos invariantes en intensidades de sonda para varios archivos CEL de Affymetrix o valores de expresión génica de dos条件实验不同。
Las rutinas专门研究微阵列的可视化数据,包括gráficas de volcán, gráficas de cajas, gráficas logarítmicas, gráficas I-R y mapas de calor espaciales del微阵列。También puede visualizar ideogramas con patron of bandas G。
芦丁树统计和机器学习工具箱™, puede clasificar los resultados, realizar clustering jerárquico y de K-means y represent los datos del microarray en visualizaciones estadísticas, tales como clustergramas 2D con un orden óptimo de hojas, mapas de calor, gráficas de components principales y árboles de clasificación。
生物信息学工具箱proporciona un CONCONCONNTO de funciones para el análisis de datos de Spectrometraía de masas。程序前许可证、分类和身份识别、马尔迪、LC/MS和GC/MS。程序前许可证的功能包括参考文件、suavizado、calibración和remuestreo。特别是在使用过程中,使用LC/MS和GC/MS对数据进行处理。这些数据代表了各种形式的特殊模拟。
是可能的,线性归一化光谱,después,我们的herramientas de clasificación y aprendizaje estadístico para crear clasificadores e identificbiomararcadores potential。
特奥里亚和格拉菲卡斯的视觉化
生物信息学工具箱permite aplicar la teoría gráfica básica矩阵扩散。普埃德·克雷尔(Puede crear),在《国际合作地图》(interacción)上的《格拉菲卡斯故事集》(manipular gráficas tales),格拉菲卡斯·杰拉尔·奎卡斯(gráficas jerárquicas)和《vías celulares》。在gráficas的cortas上可能存在确定性,可能是gráficas的ciclos公司在gráficas的中心和中心进行统一管理。
视觉化
生物信息学工具箱的功能比例是在clasificación y aprendizaje estadístico de的算法中统计和机器学习工具箱,科莫:
- 病媒分类(SVM)
- 函数对应于validación的配置实验和不同的函数对应于métodos的配置实验
- 作为选择角色的互动角色,亚洲和视觉化的角色扮演者和角色扮演者
Ontologia genica
生物信息学工具箱允许在MATLAB中使用基因本体论®,分析阿奇沃斯·阿诺塔多斯·德·奥托洛尼亚·盖尼卡和奥托洛尼亚的次青年,关于祖先、后代和当事人的故事。
Alineamiento de secuencias
根据功能、目标和任务的不同,制定相关计划,执行不同的任务和任务。员工:
- 实现MATLAB算法estándar para el alineamiento de secuencias locale y globales,故事como los algoritmos de Needleman-Wunsch, Smith-Waterman y el perfil de modelos ocultos de Markov
- 我希望大家都是进步的
- 线性结果矩阵的表示法
- 矩阵puntuación estándar,和矩阵PAM y BLOSUM一样
- Cálculo de secuencia de consenso和visualización de logotipo de secuencia
安全设施和实用设施
工具箱许可证管理者和分析者需要对数据的深度进行压缩。普埃德·哈塞尔·洛·西吉恩特:
- 转到安全的地方,再转到安全的地方,aminoácidos usando el código genético
- 实现análisis estadísticos de las secuencias y bus patron específicos dentro de una secuencia
- 应用到restricción para la asimilación mediante simulación informática应用到crear aleatorias para pueba
- 它的前身是mínima energía,它的自由前身是ARN
视觉化
Esta工具箱允许可视化安全性和一致性。在GenBank的功能区内,将地图绘制成直线或圆形。这是一种可能的可视化诊断方法。允许勘探和修改más secuencias公司的许可证。
阿纳利斯丝虫
Esta toolbox permite crear y editar árboles filogenéticos。我们可以计算距离,我们可以在nucleótidos或者aminoácidos中使用距离,我们可以在métricas中使用距离,我们可以在Jukes-Cantor中使用距离,我们可以在puntuación中使用距离,我们可以在método中定义距离。Los árboles filogenéticos se crean utilizdo el enlace jerárquico con diversas técnicas,包括la unión de vecinos, el enlace único y completo, y el promedio aritmético de grupos de pares no ponderados (UPGMA)。
拉巴斯·德阿尔伯勒大学、次阿尔伯勒大学和洛萨尔伯勒大学的课程。阿尔伯勒丝线博物馆、雷诺德纳尔和雷诺布拉·拉马斯博物馆、探索距离和新建筑的描述。公共设施的公共设施包括现有设施的基础设施。
Análisis de características de proteínas
蛋白质分泌比例表,包括芦丁类的计算比例表,用于计算蛋白质、蛋白质和比索分子的合成比例。蛋白质的氨基酸组成决定因素包括蛋白质的含量、蛋白质的含量和蛋白质的含量。在氨基酸类药物的应用中,使用可视化分子和3D中常见的雌激素分子。
档案格式以数据为基础
您可以使用以下格式:estándar de datos biológicos, base de datos online y sitios web。生物信息工具箱permite:
- 科莫法斯塔、PDB和SCF的建筑结构安全数据
- 微阵列数据格式:DAT, EXP, CEL, CHP y CDF de Affymetrix, datos de format de resultados ImaGene®,安捷伦档案馆®特征提取软件归档GPR y GAL de GenePix®
- 在GenBank, EMBL, NCBI BLAST和PDB等数据库中查找数据
- 网站基因表达综合目录
- UCSC的城市信息和城市文本档案
- MZXML和JCAMP-DX文件中的特殊数据
算法和应用程序的比较
MATLAB Proportciona Herramients提供了软件个性化应用程序中数据的许可转换程序。其中包括用户界面、用户界面、用户界面和用户界面。MATLAB PrmiTon积分LOS算法的MATLAB解法C++,C++ + java™ 有争议的问题是,在微软公司的组件中,将MATLAB的算法转换为独立的应用程序®.NET作为Microsoft Excel的一个补充,加入了一个应用程序®.
Puede积分MATLAB与bioinformática与uso习惯,como BioPerl, servicios web basados en SOAP y互补COM。