基于matlab的工具来创建自定义子网主要substrate-product对所定义的基因和基因组的京都百科全书(KEGG)。它可以用来探索transgenomic交互,例如哺乳动物和细菌的关联。它之间的最短路径计算一组代谢产物(如从metabonomic生物标志物研究)和情节之间的连接性代谢物作为链接的网络图。结果图可以改变和交互式地探索。此外,图中的节点与KEGG复合网页。
multi-systemic示例数据集提供supra-organism,这包括反应可以发生在隔间的智人,厚壁菌门和/或bacretoidetes物种。MetaboGetworks函数可用于生成自定义MetaboNetworks multi-organism数据库使用的函数。(看到我读文件)
引用作为
约兰Posma (2022)。MetaboNetworks(//www.tianjin-qmedu.com/matlabcentral/fileexchange/42684-metabonetworks), MATLAB中央文件交换。检索。