MetaboNetworks

版本2.1.0.0 (2.1 MB) 约兰Posma
一个工具箱交互式地创建、定制和探索multi-systemic代谢反应网络

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更新2017年9月5日

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基于matlab的工具来创建自定义子网主要substrate-product对所定义的基因和基因组的京都百科全书(KEGG)。它可以用来探索transgenomic交互,例如哺乳动物和细菌的关联。它之间的最短路径计算一组代谢产物(如从metabonomic生物标志物研究)和情节之间的连接性代谢物作为链接的网络图。结果图可以改变和交互式地探索。此外,图中的节点与KEGG复合网页。
multi-systemic示例数据集提供supra-organism,这包括反应可以发生在隔间的智人,厚壁菌门和/或bacretoidetes物种。MetaboGetworks函数可用于生成自定义MetaboNetworks multi-organism数据库使用的函数。(看到我读文件)

引用作为

约兰Posma (2022)。MetaboNetworks(//www.tianjin-qmedu.com/matlabcentral/fileexchange/42684-metabonetworks), MATLAB中央文件交换。检索

MATLAB版本兼容性
创建R2014a
兼容任何释放
平台的兼容性
窗户 macOS Linux
确认

启发:MatlabBGL

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