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|<https://github.com/mvallieres/radiomics>|
提供用于放射学分析的MATLAB编程工具的软件包。
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参考:
[1] Vallières, M.等人(2015)。由FDG-PET和
MRI纹理特征对肺软组织转移的预测
四肢肉瘤。物理学报,60(14),
5471 - 5496。0031 - 9155/60/14/5471 doi: 10.1088 /
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作者:Martin Vallières
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历史:
-版本1.0:2015年5月
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免责声明:
“我不是程序员,我只是个科学家!”
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***感谢您对本套餐的兴趣
如果您对这个包有任何问题、意见或建议,
请不要犹豫与我联系!
此包包含5个文件夹:
1.'TextureToolbox':从输入执行纹理分析的MATLAB代码
2D或3D感兴趣区域(ROI)。这个工具箱是自成一体的
可以在放射组学包之外单独使用。特别是,
这个纹理分析包实现了小波带通滤波,
各向同性重采样,离散化长度修正和不同
量化工具。详情请参阅参考[1]。
2.'NonTextureFeatures':用于计算纹理以外的特征的MATLAB代码
从输入的三维感兴趣区域(ROI)。包括SUV等功能
指标,AUC-CSH,不活跃百分比,尺寸,坚固度,体积和偏心度。
详情请参阅参考[1]。
3.“MultivariableModeling”:执行多变量分析的MATLAB代码
操作,如逻辑回归,引导,功能集
约简、特征集选择、预测性能估计等。
4.'Utilities': MATLAB代码用来执行不同的操作,包括
计算SUV地图,读取包含DICOM影像的目录
数据、RTstruct DICOM对象到3D面具的转换等。
5.“STUDIES”:用于特定研究的MATLAB代码。复制的
某项研究的实验,请看相应的文件夹。
- 'STSstudy': Ref.[1]。影像学资料和临床资料
可在癌症影像档案(TCIA)网站上查阅
下面是DOI: <http://dx.doi.org/10.7937/K9/TCIA.2015.7GO2GSKS >.
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致谢:其他软件代码
Wei的GLRLM工具箱:Xunkai Wei,灰度运行长度矩阵工具箱
软件,北京航空技术研究中心,2007。
<//www.tianjin-qmedu.com/matlabcentral/fileexchange/17482-gray-level-run-length-matrix-toolbox >
-李琦琦:<//www.tianjin-qmedu.com/matlabcentral/fileexchange/23377-ellipsoid-fitting >
- CERR开发团队:http://www.cerr.info/ >
Dirk-Jan Kroon (imresize3D.m): <//www.tianjin-qmedu.com/matlabcentral/fileexchange/21451-multimodality-non-rigid-demon-algorithm-image-registration/content//functions/imresize3d.m >
- David Reshef和Yakir Reshef: MINE version 1.0.1d <http://www.exploredata.net/ >
- DREES开发团队:http://www.cerr.info/drees >
Enric Junqué de Fortuny (fastAUC.cpp): <//www.tianjin-qmedu.com/matlabcentral/fileexchange/41258-faster-roc-auc >
- François Beauducel (roundsd.m): <//www.tianjin-qmedu.com/matlabcentral/fileexchange/26212-round-with-significant-digits >
- Jos van der Geest (herrorbar.m): <//www.tianjin-qmedu.com/matlabcentral/fileexchange/3963-herrorbar >
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引用作为
马丁valliere(2021)。RADIOMICSGitHub (https://github.com/mvallieres/radiomics)。检索.