Janelia自动动物行为注释器(JAABA)是一个基于机器学习的系统,使研究人员能够自动计算可解释的,定量统计描述行为动物的视频。通过我们的系统,用户通过标记动物的行为,例如行走、梳理或跟随,将他们对行为结构的直觉编码在一小组视频帧中。JAABA使用机器学习技术将这些手工标签转换为行为检测器,然后使用这些检测器在高通量的大数据集中自动分类动物的行为。我们的系统结合了一个直观的图形用户界面,一个快速和强大的机器学习算法,以及分类器的可视化,成为一个交互式的,可用的系统,用于创建自动行为检测器。JAABA是对基于视频的跟踪方法的补充,我们设想它将有助于提取详细的、有科学意义的大型实验行为效应测量值。
JAABA是一个开源、免费的程序,由HHMI Janelia农场布兰森实验室的成员开发。在《JAABA: Interactive machine learning for automatic annotation of animal behavior》(Kabra, robbie, et al., Nature Methods, 2012)中详细描述。
克里斯汀(2021)。Kristinbranson / Jaaba.GitHub (https://github.com/kristinbranson/JAABA)。检索。
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