单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术已经彻底改变了生物医学研究的方式。它为研究细胞异质性和基因表达变异性提供了前所未有的单个细胞分辨率。但是，由于数据的稀疏性和高维性，分析scRNA序列数据具有挑战性。我开发了scGEAToolbox——一个用于scRNA序列数据分析的Matlab工具箱。它包含一整套用于数据规范化、特征选择、批量校正、插补、单元聚类、轨迹/伪时间分析和网络构建的功能，这些功能可以组合和集成到构建自定义工作流中。虽然大多数函数都是在原生Matlab中实现的，但提供了包装器函数，允许用户调用用Matlab或其他语言开发的“第三方”工具。此外，scGEAToolbox配备了由App Designer生成的复杂图形用户界面（GUI），使其成为快速数据处理的易于使用的应用程序。
引用作为
Cai JJ。SCGEatoolbox：用于单单元RNA测序数据分析的MATLAB工具箱。生物信息学。2019年11月7日：BTZ830。DOI：10.1093 / Bioinformatics / BTZ830。epub领先于印刷品。PMID：31697351
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