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gQSPSim

版本1.0.2 (72 MB) Iraj Hosseini
该应用程序用于QSP建模和仿真。
5．0
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更新2020年7月23日

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gQSPSim是一个基于gui的MATLAB®应用程序，执行QSP模型开发和分析的关键步骤，包括:

1)采用全局和局部优化方法进行模型标定
2)开发虚拟主题，以探索所代表生物学的可变性和不确定性
3)不同干预措施的虚拟种群模拟。

gQSPSim与SimBiology®构建的模型一起工作，利用物种、剂量、变体和规则等组件。所有功能都配备了交互式可视化界面和生成演示图形的能力。此外，可以共享或保存标准化的gQSPSim会话，以便将来扩展和重用。

源代码和案例研究包含在引用的github帐户中。gQSPSim的描述和案例研究在题为“gQSPSim:基于SimBiology®的标准化QSP模型开发的GUI应用程序”的出版物中
和应用程序”。

产品说明:

1)在您的计算机上安装Matlab 2018a。之前的Matlab版本不兼容，我们还没有在2018b或更高版本中测试该应用程序。

2)安装GUI布局工具箱(//www.tianjin-qmedu.com/matlabcentral/fileexchange/47982-gui-layout-toolbox）

3) Mac和PC用户支持的编译器列表请参见以下链接(万博1manbetx//www.tianjin-qmedu.com/content/dam/mathworks/mathworks-dot-com/万博1manbetxsupport/sysreq/files/SystemRequirements-Release2018a_SupportedCompilers.pdf）
•3a) Mac用户安装xcode。
•3b)对于PC用户，安装其中一个支持的编译器(lcc-win64或MinGW万博1manbetx 5.3 C/ c++或Microsoft Visual c++)

4)编译器安装完成后，打开Matlab并运行以下命令
•设置c
•设置c++

5)要检查编译器是否在您的计算机上成功配置，运行以下命令:
•modelObj = sbmlimport('lotka');
•em = export(modelObj)
•加快(em);
•em.isAccelerated

答案应该是1

在Windows上启用长文件名

1)启动注册表编辑器(regedit.exe)
2)打开HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\FileSystem
3)双击LongPathsEnabled
4)设置为1，单击“确定”
5)重新启动

解压缩案例研究压缩文件在Windows上

1)下载并安装7-zip从https://www.7-zip.org/
2)使用7-zip解压案例研究zip文件

gQSPSim安装:

1)解压缩主目录下的gQSPSim.zip
2)打开Matlab
3)进入主目录“/gQSPsim/app”
4)运行QSPapp

引用作为

Iraj Hosseini(2022)。gQSPSimGitHub (https://github.com/feigelman/gQSPsim-release)。检索．

MATLAB版本兼容性
使用R2018a创建
兼容R2017b ~ R2018a
平台的兼容性
窗户 macOS Linux
社区
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