图像缩略图

黑沙们展示

用于细胞细胞生物学的全面和交互式图像分析软件工具

更新2020年10月14日

黑沙们展示is an interactive and user-friendly image analysis software tool to investigate the cell biology of common used bacterial species (e.g. Escherichia coli, Bacillus subtilis, Pseudomonas aeruginosa, etc.) and stalk-forming bacteria (e.g. Caulobacter crescentus, Hyphomonas neptunium, Brevundimonas aveniformis, etc.). BacStalk uses phase contrast, brightfield, and/or fluorescence images to segment bacteria and generate demographs, kymographs, histograms, scatterplots. For stalked bacteria, BacStalk can also identify hardly-visible bacterial stalks to observe stalk formation dynamics and bud cell growth. Fluorescence images can be used to measure protein expression patterns along cells and stalks.

Bacstalk使用非常直观和现代的图形用户界面,并提供文件处理,元数据提取,单元/杆/芽分割,单元跟踪,数据分析和可视化所需的所有工具。Bacstalk生成出版级数字,只需点击几下即可。虽然Bacstalk基于MATLAB软件,但它不需要使用任何编程知识。

引用

Hartmann,Raimo等人。“Bacstalk:用于细胞细胞生物学的全面和交互式图像分析软件工具。”分子微生物学,Vol。114,没有。1,Wiley,4月20日,PP。140-50,DOI:10.1111 / MMI.14501。

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