请随时查看NIfTI_tools.pdf的详细描述和最新更新。
如果您在分析图像的左/右侧混淆,请阅读useAnalyze.pdf。
您可能还想通过FAQ.PDF进行实际解决方案和实际示例。万博 尤文图斯
基本程序:
1. load_untouch_header_only.m:仅加载NIFTI或Analyze文件的标题部分。将自动检测到输入文件。NIFI结构将返回NIFI文件,并将返回分析结构进行分析文件。
2.加载_nii.m: Load N-Dimensional NIfTI file (where N can be from 3 to 7) or ANALYZE file (where N can be from 3 to 4), and apply header info (e.g. affine geometric transform, voxel intensity scaling, etc.) to the data. If your file has more than 3-Dimension (e.g. time series etc.), you can also specify a range to extract only 1 or several volumes.
3. save_nii.m:保存n维nifti结构(其中n可为3到7),由“load_nii.m”或由“make_nii.m”进行到nifti文件中。
4. make_nii.m:基于n维矩阵和其他可选参数(例如voxel_size,原点等)制作n维NIFI结构(其中n可以为3到7)。使用“save_nii”命令,“make_nii”制作的nifti结构可以保存到nifti文件中。
5. make_ana.m:基于3D矩阵和其他可选参数(例如Voxel_size,Origin等)进行3D分析结构。使用“save_untouch_nii”命令,“make_ana”制作的分析结构可以保存到分析文件中,以便与某些分析仅兼容程序。
6.reslice_nii。m:重新采样3D(或4D) NIfTI文件,或。mat文件中带有仿射矩阵m的ANALYZE文件,并将重新采样的数据保存到新的NIfTI文件中。该程序将基于仿射矩阵,这是特别有用的斜图像与非正交旋转或剪切,不能加载“load_nii.m”。你也可以指定voxel_size等。只要你记得在使用"reslice_nii.m"后不要做切片时间校正,就不会产生负面影响。
7. PAD_NII.M:从六个边中的任何一个填充NIFI结构中的卷,同时保持发起者,体素大小,数据类型和描述不变。在使用Reslice_nii之后,该程序特别有用,因为新卷很可能具有不同的尺寸。
8.剪辑_NII.M:将NIFI结构中的卷从六个边中的任何一个剪切,同时保持发起者,体素大小,数据类型和描述不变。在使用Reslice_nii之后,该程序特别有用,因为新卷很可能具有不同的尺寸。
9.查看_NII.M:查看和编辑3D(或4D)NIFTI或Analyze结构,由“make_nii.m”加载或由“make_nii.m”进行。激活图,ROI等可以覆盖在背景图像的顶部(见上图)。绘制视图可以嵌入到现有的数字窗口中。如果将其作为单独的程序,它还可以编辑图像的方向和体素值,查看卷直方图,并保存修改后的图像。
10. load_untouch_nii.m:加载n维nifti文件(其中n可以为3到7)或分析文件(其中n可以为3到4),但不应用标题中指示的任何更改。警告:请勿使用“View_nii.m”查看“load_untouch_nii.mm”加载的结构。
11. save_untouch_nii.m:保存n维NIFI结构(其中N可以为3到7)或分析结构(其中n可以为3到4),由“load_untouch_nii.m”或由“make_ana制作。m“进入新的nifti或分析文件。如果不修改加载的数据集,则新保存文件中的标题和数据应与原始文件中的标头和数据相同。
其他计划:
1. collass_nii_scan.m:将多个单扫描NIFTI或分析文件集成到多扫描NIFTI文件中。
2.expand_nii_scan。m:将一个多次扫描的NIfTI文件分解为多个单次扫描的NIfTI文件。
3.save_untouch_slice。m:保存回原始图像,其中包含由load_untouch_nii加载的部分切片。您可以以任何方式处理这些切片矩阵,只要它们的维数没有改变。
4. get_nii_frame.m:返回nifti文件的时间帧数。
5. flip_lr.m:沿着发起者沿着飞机沿着飞机向右分析文件,并将L-R翻转到NIFI文件中的左右分析。警告:请谨慎使用此程序,虽然您可以随时将其翻新。
6. load_nii_ext.m:从nifti文件中加载标头扩展名。
7. MAT_INTO_HDR.M:将旧SPM .mat文件中的仿射矩阵集成到其.hdr头文件中。因此,分析文件将使用更新的.hdr头文件转换为nifti文件。
引用作为
吉米沈(2021)。NIfTI和分析图像的工具(//www.tianjin-qmedu.com/matlabcentral/fileexchange/8797-tools-for-nifti-and-analyze-image), MATLAB中央文件交换。检索。
Matlab释放兼容性
平台兼容性
窗户 麦克斯 Linux.类别
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确认
灵感来自:MRI分析工具
启发:pcg_unwrap_2d(ph_nii,ph_file,mask_nii,max_iter,epsi_con,n)那MRIqual那BioImage Suite Web.那ExportPnkscape(文件名,DPI,句柄)那MRI数据的参数映射脚本那fmridata工具那NIFTI Studio那多模态卷分割的可视化那西门子DICOM排序和转换为NIFI那双极性Colormap.那生成合成的fMRI数据那快速成像:扩散成像的常规保障管道那3d nifti数据查看器那从秒到小时,分钟,秒那复合映像那create_mosaic.m.那现场映射工具箱那用于查看MRI切片的功能那加载和查看。nii文件的GUI。那DICOM到NIfTI转换器那使用逐步聚类方法在脑功能磁共振成像数据中发现功能网络那脑统治者