图像缩略图

NIfTI和分析图像的工具

版本1.27.0.0(426 kB) 吉米沈
加载,保存,制作,Reslice,View(和编辑)NIFTI和分析任何平台上的数据

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更新2014年1月22日

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编辑注意:流行文件2018年2019年2020.

请随时查看NIfTI_tools.pdf的详细描述和最新更新。

如果您在分析图像的左/右侧混淆,请阅读useAnalyze.pdf。

您可能还想通过FAQ.PDF进行实际解决方案和实际示例。万博 尤文图斯

基本程序:

1. load_untouch_header_only.m:仅加载NIFTI或Analyze文件的标题部分。将自动检测到输入文件。NIFI结构将返回NIFI文件,并将返回分析结构进行分析文件。

2.加载_nii.m: Load N-Dimensional NIfTI file (where N can be from 3 to 7) or ANALYZE file (where N can be from 3 to 4), and apply header info (e.g. affine geometric transform, voxel intensity scaling, etc.) to the data. If your file has more than 3-Dimension (e.g. time series etc.), you can also specify a range to extract only 1 or several volumes.

3. save_nii.m:保存n维nifti结构(其中n可为3到7),由“load_nii.m”或由“make_nii.m”进行到nifti文件中。

4. make_nii.m:基于n维矩阵和其他可选参数(例如voxel_size,原点等)制作n维NIFI结构(其中n可以为3到7)。使用“save_nii”命令,“make_nii”制作的nifti结构可以保存到nifti文件中。

5. make_ana.m:基于3D矩阵和其他可选参数(例如Voxel_size,Origin等)进行3D分析结构。使用“save_untouch_nii”命令,“make_ana”制作的分析结构可以保存到分析文件中,以便与某些分析仅兼容程序。

6.reslice_nii。m:重新采样3D(或4D) NIfTI文件,或。mat文件中带有仿射矩阵m的ANALYZE文件,并将重新采样的数据保存到新的NIfTI文件中。该程序将基于仿射矩阵,这是特别有用的斜图像与非正交旋转或剪切,不能加载“load_nii.m”。你也可以指定voxel_size等。只要你记得在使用"reslice_nii.m"后不要做切片时间校正,就不会产生负面影响。

7. PAD_NII.M:从六个边中的任何一个填充NIFI结构中的卷,同时保持发起者,体素大小,数据类型和描述不变。在使用Reslice_nii之后,该程序特别有用,因为新卷很可能具有不同的尺寸。

8.剪辑_NII.M:将NIFI结构中的卷从六个边中的任何一个剪切,同时保持发起者,体素大小,数据类型和描述不变。在使用Reslice_nii之后,该程序特别有用,因为新卷很可能具有不同的尺寸。

9.查看_NII.M:查看和编辑3D(或4D)NIFTI或Analyze结构,由“make_nii.m”加载或由“make_nii.m”进行。激活图,ROI等可以覆盖在背景图像的顶部(见上图)。绘制视图可以嵌入到现有的数字窗口中。如果将其作为单独的程序,它还可以编辑图像的方向和体素值,查看卷直方图,并保存修改后的图像。

10. load_untouch_nii.m:加载n维nifti文件(其中n可以为3到7)或分析文件(其中n可以为3到4),但不应用标题中指示的任何更改。警告:请勿使用“View_nii.m”查看“load_untouch_nii.mm”加载的结构。

11. save_untouch_nii.m:保存n维NIFI结构(其中N可以为3到7)或分析结构(其中n可以为3到4),由“load_untouch_nii.m”或由“make_ana制作。m“进入新的nifti或分析文件。如果不修改加载的数据集,则新保存文件中的标题和数据应与原始文件中的标头和数据相同。

其他计划:

1. collass_nii_scan.m:将多个单扫描NIFTI或分析文件集成到多扫描NIFTI文件中。

2.expand_nii_scan。m:将一个多次扫描的NIfTI文件分解为多个单次扫描的NIfTI文件。

3.save_untouch_slice。m:保存回原始图像,其中包含由load_untouch_nii加载的部分切片。您可以以任何方式处理这些切片矩阵,只要它们的维数没有改变。

4. get_nii_frame.m:返回nifti文件的时间帧数。

5. flip_lr.m:沿着发起者沿着飞机沿着飞机向右分析文件,并将L-R翻转到NIFI文件中的左右分析。警告:请谨慎使用此程序,虽然您可以随时将其翻新。

6. load_nii_ext.m:从nifti文件中加载标头扩展名。

7. MAT_INTO_HDR.M:将旧SPM .mat文件中的仿射矩阵集成到其.hdr头文件中。因此,分析文件将使用更新的.hdr头文件转换为nifti文件。

引用作为

吉米沈(2021)。NIfTI和分析图像的工具(//www.tianjin-qmedu.com/matlabcentral/fileexchange/8797-tools-for-nifti-and-analyze-image), MATLAB中央文件交换。检索

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