GQSPSIM是一个基于GUI的MATLAB®应用程序,在QSP模型开发和分析中执行关键步骤,包括:
1)采用全局和局部优化方法进行模型标定
2)虚拟科目的发展探讨代表生物学中的变异性和不确定性
3)针对不同干预措施的虚拟群体模拟。
GQSPSIM与Simbiology®建造的模型一起使用,利用物种,剂量,变体和规则等组件。所有功能都配备了交互式可视化界面和生成呈现准备数字的能力。此外,可以共享标准化的GQSPIM会话以供将来的扩展和重用共享或保存。
源代码和案例研究包含在引用的GitHub帐户中。GQSPSIM和案例研究的描述在标题为“GQSPSIM:基于SimBiology®的GUI应用程序,用于标准化QSP模型开发和应用程序”。
指示:
1)在您的计算机上安装Matlab 2018a或更高版本。以前的版本的Matlab是不兼容的。
2)有关Mac和PC用户的支持编译器列表,请参阅以下链接(万博1manbetx//www.tianjin-qmedu.com/content/dam/mathworks/mathworks-dot-com/万博1manbetxsupport/sysreq/files/systemrequirements-release2018a_supportedcompilers.pdf.)
•2A)对于Mac用户,请安装Xcode。
•2b) PC用户,安装一个支持的编译器(lcc-win64或MinGW 5.万博1manbetx3 C/ c++或Microsoft Visual c++)
3)安装编译器后,打开MATLAB并运行以下命令
•mex -setup
•mex -setup c ++
4)要检查编译器是否在您的计算机上配置成功,请运行以下命令:
•modelobj = sbmlimport('lotka');
•em = export(modelObj)
•加快(em);
•em.isAccelerated
答案应该是1
在Windows上启用长文件名
1)启动注册表编辑器(Regedit.exe)
2)导航到HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\FileSystem
3)双击LongPathsEnabled
4)设置为1并单击“确定”
5)重新启动
Lemendring案例研究Windows上的ZIP文件
1)下载并安装7-ziphttps://www.7-zip.org/
2)使用7-zip来解压缩案例研究zip文件
GQSPSIM安装:
1)打开matlab
2)安装GQSPSIM.MLTBX
3)在APPS工具栏中运行gQSPSim
更新v1.1
*与R2018A-2020B的兼容性
*最新个案研究
*并行队列生成和模拟的改进
*改善了会话的跨平台兼容性
*限制绘制图时显示的可配置轨迹数量
*改进了对任务的规则/反应的选择
*改进了对Window万博1manbetxs长文件名的支持
*捆绑图形库依赖
*各种错误修复
引用
Iraj Hosseini(2021)。GQSPSIMGitHub (https://github.com/gQSPSim/gQSPsim-release/releases/tag/v1.1)。检索。