主要内容

高通量测序

下一代测序(NGS)数据的基因表达、转录因子和甲基化分析，包括RNA-Seq和ChIP-Seq

高通量测序方法产生大量的序列数据，需要稳健的计算工具进行进一步分析。生物信息学工具箱™提供算法来支持下一代测序(NGS)数据的常见分析工作流程，例如过滤和修剪读取万博1manbetx，将读取映射到引用，计算映射到基因组特征的读取数，以及执行统计分析。

突出主题

类别

  • 数据导入
    从SAM、BAM、FASTA、FASTQ、GTF和GFF文件中导入NGS数据和特征注释
  • 预处理
    使用单端和配对端读取、过滤和修剪读取管理NGS数据，并显示质量统计信息
  • 对齐
    映射读取到引用序列
  • 统计分析
    阅读RNA-seq和ChIP-seq数据的摘要和统计分析
  • 可视化
    可视化读取到引用序列的对齐