模拟生物学
对生物系统进行建模、模拟和分析
模拟生物学®提供用于建模、模拟和分析动态系统的应用程序和编程工具，重点关注定量系统药理学（QSP）、生理药代动力学（PBPK）和药代动力学/药效学（PK/PD）应用程序。您可以使用SimBiology框图编辑器以交互方式构建模型，也可以使用MATLAB以编程方式构建模型®语言您的模型可以从头开始创建、作为SBML格式的文件导入，或者基于SimBiology中提供的模型示例构建。
SimBiology提供了各种技术，用于分析复杂度和大小不等的基于ODE的模型。您可以运行模拟来评估目标可行性，预测药物疗效和安全性，并确定最佳给药计划。您可以使用局部和全局敏感性分析确定关键路径和参数，并通过运行参数扫描来评估生物可变性。要估计参数，可以使用非线性回归和非线性混合效应技术拟合数据，并执行非房室分析（NCA）。
开始：
SimBiology社区
使用SimBiology和MATLAB进行QSP、PBPK和PK/PD建模的科学家的聚集地。
建筑模型
建筑定量系统药理学（QSP）生理药代动力学（PBPK），或药代动力学/药效学（PK/PD）就像您使用SimBiology Model Builder在一张纸上绘制模型一样。
将替代数量值存储为模型变量。
评估给药策略
定义和评估给药策略。评估联合疗法的益处，并通过结合针对不同模型物种的给药计划确定最佳给药策略。
模拟模型
使用多种确定性和随机解算器模拟模型的动态行为SimBiology模型分析器或编程工具。
选择解算器
从几个可用的确定性解算器中选择一个，包括MATLAB常微分方程求解器和日晷解算器，或选择随机解算器，包括随机模拟算法（SSA）、显式tau跳跃和隐式tau跳跃。
通过向上扩展到群集和云，提高模拟性能。
非部门分析
根据药物浓度的时间过程测量值计算药物的药代动力学参数，无需假设房室模型。使用稀疏或串行采样，对单次或多次给药的实验和模拟数据执行NCA。
以线性和半对数标度显示的浓度-时间数据的AUC计算。
二室PK模型的高斯参数置信区间。
非线性混合效应技术（NLME）
使用NLME方法，使用期望最大化随机近似（SAEM）、一阶条件估计（FOCE）、一阶估计（FO）、线性混合效应（LME）近似或受限LME近似拟合总体数据。
非线性混合效应法的进度图。
内置程序和交互式探索工具
使用SimBiology Model Analyzer应用程序的内置分析步骤编写分析程序。使用滑块以交互方式探索参数或剂量计划变化对模型结果的影响。
全局和局部敏感性分析
通过进行局部或全局敏感性分析，探索模型数量变化对模型响应的影响。使用全局敏感性分析，了解哪些模型输入驱动参数空间中的模型响应，并告知参数估计策略。
自定义分析
通过MATLAB脚本以编程方式使用SimBiology来自动化分析和创建自定义分析。您还可以使用社区提供的工具作为附加组件，对SimBiology模型（如虚拟人口模拟）执行自定义分析。
来自SimBiology在线社区的社区贡献工具。
构建和部署Web应用程序
使用创建应用程序应用程序设计师，使用MATLAB编译器对其进行打包™, 并使用MatlabWeb应用服务器™. 合作者可以使用浏览器访问和运行web应用程序，而无需安装任何软件。
