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机器学习辅助高光谱成像

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利用高光谱显微镜和机器学习自动检测纳米颗粒

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更新2017年4月20日

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利用高光谱显微镜自动检测纳米颗粒
纳米颗粒被广泛用作生物医学成像探针和潜在的治疗剂。随着新粒子在体内的开发和测试,表征其生物分布特征至关重要。我们展示了一种新的方法,该方法使用自适应算法分析高光谱暗场图像,以研究组织与给药纳米颗粒之间的相互作用。这种非破坏性技术可定量识别离体组织切片中的颗粒,并可详细观察由器官特异性清除机制、颗粒大小和纳米颗粒表面涂层的分子特异性引起的累积模式。与电子显微镜下的纳米颗粒吸收研究不同,该方法适用于大视场成像。自适应高光谱图像分析具有良好的检测灵敏度和特异性,能够识别单个纳米颗粒。利用这种方法,我们收集了关于几种金纳米颗粒在小鼠体内的亚器官分布的第一批数据,并观察了它们在肿瘤中的定位模式。
图像显示,从左到右:染色切片的亮场显微镜图像、暗场显微镜、高光谱显微镜、纳米颗粒检测,以橙色显示。
该作品于2016年8月在eLife上发表:https://elifesciences.org/content/5/e16352.
如果您使用此代码,请引用我们的论文。
“在组织学样品中测定纳米材料微观物理命运的高光谱方法”。
ED SoRelle,O Liba,JL Campbell,R Dalal,CL Zavaleta,A Zerda,eLife,2016
注:代码基于在使用Envi进行高光谱成像的Cytoviva显微镜上获取的图像。
该项目包括从Matlab文件交换的Envi读取代码:
//www.tianjin-qmedu.com/matlabcentral/fileexchange/27172-envi-file-reader-writer

引用为

奥利·利巴(2021年)。机器学习辅助高光谱成像(https://github.com/orlyliba/HSM-AD),GitHub。恢复.

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