创建模型Receptor-Ligand动力学- MATLAB和Simulink MathWorks澳大利万博1manbetx亚

创建Receptor-Ligand动力学的模型

这个例子展示了如何创建和receptor-ligand动力学使用的模拟一个简单的模型SimBiology模型构建器和SimBiology模型分析应用程序。

在这个模型中,配体l和受体R物种形成receptor-ligand复合物通过可逆的结合反应。这些反应是使用质量作用动力学定义 $\frac{d C}{d t} = k_{f} \cdot l \cdot R - k_{r} \cdot C$ ,在那里k_f和k_r正向和反向速率常数。l,R,C配体的浓度,受体,分别和receptor-ligand复杂。

开放模型构建器应用程序

单击SimBiology模型构建器图标应用程序选项卡或输入simBiologyModelBuilder在命令行中。

构建模型

在家标签的应用,选择模型>创建新的空白模型。输入m1作为模型的名称。这个应用程序创建一个空舱不愿透露姓名的和显示的隔间图选项卡。
拖放三块物种块和一个反应进舱。可选地,您可以重命名的物种和舱通过双击默认名称。例如,改变不愿透露姓名的来细胞。
连接反应的物种,按住Ctrl键(在Windows上^®和Linux^®)或选项键(macOS),单击物种,并拖动。
点击反应阻止其属性的属性编辑器窗格。设置以下参数。
- 选择可逆的>真正的。
- 在州表,更新的值l来5和R来10。设置的单位l,R,C物种nanomole /升。
- 远期利率的值参数设置k_f来0.05。设置单位升/ nanomole /小时。
- 逆向速率参数的值k_r来0.1与单位1 /小时。
单击细胞在图中舱。在属性编辑器窗格中,设置它单位来升。