SimBiology提供了一组集成的应用程序,旨在促进构建、模拟和分析动态系统的模型,如定量系统药理学(QSP)、药代动力学/药效学(PK/PD)和系统生物学模型。
的SimBiology模型构建器App允许你使用各种建模元素交互式地构建动态模型。例如,您可以对多种生物系统建模,如信号通路、代谢网络、PBPK、QSP和PK/PD模型。它还可以让你模拟生物变异和不同的剂量方案,以调查各种实验条件和剂量策略。
的SimBiology模型分析这款应用程序可以让你对动态系统模型进行分析。您可以使用各种求解器模拟模型的动态行为,并估计模型参数。为了研究系统动力学并指导实验,您可以执行灵敏度分析和参数扫描。
SimBiology模型构建器 | 交互式建立QSP, PK/PD和机械系统生物学模型 |
SimBiology模型分析 | 分析QSP, PK/PD和机械系统生物学模型 |
simbio.diagram.getBlock |
获取SimBiology图表块属性 |
simbio.diagram.setBlock |
设置SimBiology图表块属性 |
simbio.diagram.getLine |
获得SimBiology图表线属性 |
simbio.diagram.setLine |
设置SimBiology图表线属性 |
simbio.diagram.splitBlock |
在图中分裂SimBiology物种块 |
simbio.diagram.joinBlock |
在图表中结合SimBiology物种块的所有副本 |
这个例子展示了如何创建和模拟受体-配体动力学的简单模型SimBiology模型构建器和SimBiology模型分析应用程序。
使用SimBiology模型构建器将SGLT2抑制纳入基于生理的葡萄糖-胰岛素模型
将钠-葡萄糖共转运体2 (SGLT2)受体抑制通过一种假设的化合物纳入现有的葡萄糖-胰岛素模型。
在图中构建模型时复制和粘贴SimBiology块。
的SimBiology®库是可用于构建和分析模型的内置组件集合。
的SimBiology模型构建器应用程序使用上下文图标来提供关于浏览器表和块中的模型组件的更多信息图选项卡。
您可以撤消和重做与模型构建和配置块属性相关的操作。
的SimBiology模型构建器App为各种建模操作提供键盘快捷键。
生成包含模型信息的报告。
使用SimBiology模型分析仪App计算NCA参数并将模型拟合到PK/PD数据中
使用非线性回归对PKPD实验数据进行拟合,进行非区室分析并校准模型参数。
使用SimBiology模型分析仪App进行灵敏度分析,找到重要参数
进行敏感性分析,找出重要的模型参数。
使用SimBiology模型分析仪应用程序模拟生物变异与虚拟患者
为模型参数生成样本值,以表示虚拟患者,并进行模拟,以探索模型的可变性。
探索满足疗效和毒性阈值的多个剂量。
的SimBiology模型分析App为各种分析操作提供键盘快捷键。
生成包含程序分析结果的报告。
使用百分位图可视化实验数据和模拟统计。