主要内容

UnitConversion

执行单位转换

描述

UnitConversion属性指定是否在模拟之前对模型执行单元转换。它是CompileOptions对象。CompileOptions属性的对象属性保存模型的编译时选项configset对象。

UnitConversion设置为真正的,模拟生物学®软件将匹配的物理量转换为一个一致的单位系统,以便解析它们。这种转换是为正确的模拟做准备的,但是物种数量是以用户指定的单位返回的。

例如,考虑一个反应A + b - > c.利用质量作用动力学,反应速率定义为a * b * k在哪里k是反应的速率常数。如果你指定初始量一个而且b分别为0.01M和0.005M,则k1 / (M *秒).如果你指定k例如,用另一个等价的单位定义,1 /((分子/升)*秒)UnitConversion后发生DimensionalAnalysis

单位转换需要量纲分析。如果DimensionalAnalysis是关了,你又转UnitConversion上之后,DimensionalAnalysis自动打开。如果UnitConversion是开着的,你把它关了DimensionalAnalysis,然后UnitConversion自动关闭。

如果UnitConversion失败,然后在模拟(sbiosimulate).

如果UnitConversion设置为时,模拟使用给定的对象值。

特征

适用于 对象:CompileOptions(在configset对象)
数据类型 布尔
数据值

真正的.默认值为

访问 读/写

请注意

SimBiology使用的单位包括与之关联的空单位DimensionalAnalysis而且UnitConversion特性。

  • DimensionalAnalysis而且UnitConversion都是,单位不使用。然而,SimBiology仍然执行最低水平的量纲分析,以确定反应速率的量纲是量/时间还是浓度/时间。

  • DimensionalAnalysis真正的而且UnitConversion,单位(如果不是空的)必须具有一致的尺寸,以便SimBiology可以执行量纲分析。但是,单位不进行转换。

  • UnitConversion设置为真正的(需要DimensionalAnalysis真正的), SimBiology执行量纲分析,并将所有内容转换为一致的单位。因此,您必须指定一致的单元,并且任何单元都不能为空。如果你有一个无量纲参数,你仍然必须设置它的单位为无量纲的

提示

如果你有一个自定义函数UnitConversion开启,请遵循下面的建议。

  • 如果传递给函数的参数不是无量纲的,则对它们进行无量纲化。

    假设您有一个自定义函数定义为Y = f(t)在哪里t时间是以小时为单位的吗y是一种物质的浓度,单位是摩尔/升。当你在你的模型中使用这个函数来定义一个重复赋值规则时,例如,将它定义为:S1 = f(时间/t0)*s0,在那里时间为模拟时间,t0是一个参数,定义为1.0小时,s0参数是否定义为1.0 mol /l,和s1是一种物质的浓度,单位是摩尔/升。请注意,时间而且s1不一定要在同一个单位t0而且s0,但它们必须在维度上保持一致。例如,时间而且s1单位可以分别设置为分钟和皮摩尔/升。

例子

这个例子展示了如何检索和设置unitconversion从默认真正的在模型对象中设置的默认配置中。

  1. 导入模型。

    modelObj = sbmlimport('振荡器')

    SimBiology模型-振荡器模型组件:模型:0参数:0反应:42规则:0物种:23
  2. 检索configset模型对象的。

    configsetObj = getconfigset(modelObj) Configuration Settings - default (active) SolverType: ode15s StopTime: 10.000000 SolverOptions: AbsoluteTolerance: 1.000000e-006 RelativeTolerance: 1.000000e-003 RuntimeOptions: StatesToLog: all CompileOptions: UnitConversion: false DimensionalAnalysis: true
  3. 检索CompileOptions对象。

    optionsObj = get(configsetObj,'CompileOptions')编译设置:UnitConversion: false维度分析:true
  4. 赋值为falseUnitConversion

    集(optionsObj, UnitConversion,真的)

另请参阅

得到getconfigsetsbiosimulate