mzcdf2peaks

转换mzCDF结构峰列表

句法

[Peaklist，时] = mzcdf2peaks（mzCDFStruct）

输入参数

mzCDFStruct

MATLAB®根据NetCDF文件结构包含信息，例如一个由所创建的mzcdfread功能。其字段对应于一个netCDF文件的变量和全局属性。如果一个NetCDF变量包含局部属性，一个附加的字段被创建，与场被变量名所附的名称_attributes。数量和字段的名称会有所不同，这取决于质谱仪软件，但通常有mass_values和intensity_values领域。

输出参数

Peaklist

以下任一操作：

  • 其中第一列包含质量/电荷（M / Z）值，第二列的两列的矩阵，包含离子强度值。

  • 单元阵列峰列表，其中每个元素是m / z值和离子强度值，并且每个元素对应的两列的矩阵的光谱或保留时间。
时

的用液相色谱/质谱（LC / MS）或气相色谱法/质谱法（GC / MS）数据集相关联的保留时间矢量的标量。如果时是一个矢量，元件的数量等于包含在峰值列表的数目Peaklist。

描述

[Peaklist，时] = mzcdf2peaks（mzCDFStruct）提取从峰值信息mzCDFStruct从netCDF文件包含的信息的结构MATLAB，诸如一个由所创建的mzcdfread功能，并创建Peaklist中，单个矩阵或含有质量/电荷（M / Z）值和离子强度值矩阵的单元阵列，和时，用液体色谱/质谱相关的保留时间标量或向量（LC / MS）或气相色谱法/质谱法（GC / MS）的数据集。

mzCDFStruct包含对应于一个netCDF文件的变量和全局属性的字段。如果一个NetCDF变量包含局部属性，一个附加的字段被创建，与场被变量名所附的名称_attributes。数量和字段的名称会有所不同，这取决于质谱仪软件，但通常有mass_values和intensity_values领域。

例子

在下面的例子中，文件results.cdf不提供。

  1. 使用mzcdfread函数读取NetCDF文件到MATLAB软件的结构。然后提取从结构的峰的信息。

    mzcdf_struct = mzcdfread（ 'results.cdf'）;[峰值，时间] = mzcdf2peaks（mzcdf_struct）峰= [7008x2单] [7008x2单] [7008x2单] [7008x2单]时间= 8.3430 12.6130 16.8830 21.1530

  2. 创建包含每个峰列表（保留时间）的颜色的颜色映射。

    颜色= HSV（numel（峰值））;

  3. 创建峰的3 d图形和标签添加到它。

    上对于i = 1图保持：numel（峰）T = repmat（（i）时，大小（峰{I}，1），1）;plot3（T，峰{I}（：，1），峰{I}（：，2）， '颜色'，颜色（I，:)）端视图（70,60）xlabel（ '时间'）ylabel（mzcdf_struct.mass_axis_label）zlabel（mzcdf_struct.intensity_axis_label）

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