mzcdfread
从netCDF文件读取质谱数据
语法
mzCDFStruct= mzcdfread (文件)mzCDFStruct= mzcdfread (文件……“TimeRange”,TimeRangeValue,……)mzCDFStruct= mzcdfread (文件……“ScanIndices”,ScanIndicesValue,……)mzCDFStruct= mzcdfread (文件,……‘详细’,VerboseValue,……)
输入参数
文件 |
包含包含质谱数据并符合ANDI/MS或ASTM E2077-00(2005)标准规范或早期规范的netCDF文件的文件名或路径和文件名的字符向量或字符串。 如果只指定文件名，则该文件必须在MATLAB中®搜索路径或在当前文件夹中。 |
TimeRangeValue |
双元素数值数组 提示时间单位在netCDF全局属性中显示。有关netCDF文件中时间范围的摘要信息，请使用 请注意如果你指定 |
ScanIndicesValue |
正整数、整数的向量或两个元素的数字数组 提示有关netCDF文件中扫描索引的信息，请检查 请注意如果你指定 |
VerboseValue |
控件的读取进度的显示 |
输出参数
mzCDFStruct |
包含来自netCDF文件的质谱信息的MATLAB结构。它的字段对应于netCDF文件中的变量和全局属性。如果netCDF变量包含本地属性，则创建一个附加字段，字段的名称是附加的变量名称 |
描述
mzCDFStruct= mzcdfread (文件)文件，然后创建一个MATLAB结构，mzCDFStruct。
文件是包含包含质谱数据的netCDF文件的文件名或路径和文件名的字符向量或字符串。文件必须符合ANDI/MS或ASTM E2077-00(2005)标准规范或更早的规范。
mzCDFStruct包含与netCDF文件中的变量和全局属性相对应的字段。如果netCDF变量包含本地属性，则创建一个附加字段，字段的名称是附加的变量名称_attributes。场的数量和名称会因质谱仪软件的不同而有所不同，但通常都是有的mass_values和intensity_values字段。
提示
LC/MS数据分析需要来自操作系统的大量内存。
如果您收到的错误有关内存，尝试以下:
如中所述增加操作系统的虚拟内存(交换空间)解决“内存不足”错误(MATLAB)。
如果收到与Java相关的错误®堆空间，增加你的Java堆空间:
如果您有MATLAB版本7.10 (R2010a)或更高版本，请参阅Java堆内存首选项(MATLAB)。
如果您有MATLAB版本7.9 (R2009b)或更早版本，请参阅//www.tianjin-qmedu.com/万博1manbetxsupport/万博 尤文图斯solutions/en/data/1-18I2C/。
mzCDFStruct= mzcdfread (文件,……”PropertyName”,PropertyValue,……)mzcdfread使用属性名/属性值对的可选属性。可以按任意顺序指定一个或多个属性。每一个PropertyName必须用单引号括起来，不区分大小写。这些属性名称/属性值对如下:
mzCDFStruct= mzcdfread (文件……“TimeRange”,TimeRangeValue,……)文件阅读。TimeRangeValue是两个元素的数字数组吗(开始结束)。默认是读取光谱从所有时间[0正]。
提示
时间单位在netCDF全局属性中显示。有关netCDF文件中时间范围的摘要信息，请使用mzcdfinfo函数。
请注意
如果你指定TimeRangeValue，您不能指定ScanIndicesValue。
mzCDFStruct= mzcdfread (文件……“ScanIndices”,ScanIndicesValue,……)文件阅读。ScanIndicesValue是正整数，整数的向量，还是两个元素的数字数组[Start_Ind End_Ind]。Start_Ind和End_Ind表示扫描索引号的每个正整数。Start_Ind必须小于End_Ind。默认读取所有扫描。
提示
有关netCDF文件中扫描索引的信息，请检查NumberOfScans属性返回的结构中的字段mzcdfinfo函数。
请注意
如果你指定ScanIndicesValue时，不能指定aTimeRangeValue。
mzCDFStruct= mzcdfread (文件,……‘详细’,VerboseValue,……)文件。的选择是真正的(默认)或假。
例子
在下面的示例中，文件results.cdf没有提供。
将netCDF文件作为结构读入MATLAB软件。
= mzcdfread(“results.cdf”);
通过创建包含强度和m/z值的单独变量，然后绘制这些值，在netCDF文件中查看第二次扫描。添加标题和x- - -y在输出结构中使用字段的轴标签。
idx1 = out.scan_index (2) + 1;idx2 = out.scan_index (3);y = out.intensity_values (idx1: idx2);z = out.mass_values (idx1: idx2);标题(sprintf('Time: %f'，out. scan_licention_time (2)))
介绍了R2008b
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