sbioaccelerate
准备加速模拟模型对象
语法
描述
sbioaccelerate (准备加速仿真的模型对象使用其活跃的配置设置(configset),任何积极的变异和活跃的剂量。一个SimBiology®模型可以包含多个configsets只有一个思想活跃在任何给定的时间。活动configset包含设置用于模型准备加速度。modelObj)
加速模拟,使用sbioaccelerate在运行之前sbiosimulate。你必须使用相同的模型和configset两种功能。
重新运行sbioaccelerate之前,调用sbiosimulate如果你修改这个模型,如改变反应或添加事件。不过,也有例外。有关详细信息,请参见当重新运行加速度。
请注意
如果您使用的是SimFunction对象模拟,它会自动加速模型首次评估函数。因此没有必要sbioaccelerate事先。
先决条件
为加速准备您的模型模拟,安装和设置一个万博1manbetx受支持的编译器。有关详细信息,请参见先决条件加速模拟和分析。
sbioaccelerate (使用configset对象modelObj,csObj,variantObj,doseObj)csObj,变体数组指定的对象或变体variantObj数组指定的对象或剂量和剂量doseObj。任何其他configset、剂量和变异被忽略。
如果你设置csObj来[],那么函数使用活跃configset对象。
如果你设置variantObj来[],那么这个函数使用没有变异。
如果你设置doseObj来[],那么函数不使用剂量。
例子
准备一个加速仿真的模型
加载一个SimBiology项目,命名洛特卡,包含一个模型m1。
sbioloadproject (“洛特卡”,“m1”)
为加速模型模拟。
sbioaccelerate (m1);
模拟模型使用不同的初始数量的物种x。
x = sbioselect (m1,“类型”,“物种”,“名字”,“x”);为我= 1:5 x。initialAmount =我;sd (i) = sbiosimulate (m1);结束
策划的结果。
sbioplot (sd);
加速模拟使用用户定义的Configset对象
加载一个样本SimBiology项目。
sbioloadprojectradiodecay.sbproj
添加一个新的配置设置使用一个不同的停止时间15秒。
csObj = addconfigset (m1,“newStopTimeConfigSet”);csObj。StopTime = 15;
为加速模型模拟使用新的configset对象。
sbioaccelerate (m1, csObj);
使用同一个configset对象模拟模型。
sim = sbiosimulate (m1, csObj);sbioplot (sim);
加速模拟数组的剂量
加载一个样本SimBiology项目。
sbioloadprojectradiodecay.sbproj
增加物种的数量x由100个分子在2和4秒通过添加剂量。
dObj1 = adddose (m1,“d1”,“安排”);dObj1。数量= 100;dObj1。AmountUnits =“分子”;dObj1。TimeUnits =“第二”;dObj1。时间= 2;dObj1。TargetName =“unnamed.x”;dObj2 = adddose (m1,“d2”,“安排”);dObj2。数量= 100;dObj2。AmountUnits =“分子”;dObj2。TimeUnits =“第二”;dObj2。时间= 4;dObj2。TargetName =“unnamed.x”;
为加速模型模拟使用剂量的数组。
sbioaccelerate (m1, [dObj1 dObj2]);
模拟模型不使用剂量或任何剂量数组的子集而无需重新运行sbioaccelerate。
sim1 = sbiosimulate (m1);sim2 = sbiosimulate (m1, dObj1);sim3 = sbiosimulate (m1, dObj2);sim4 = sbiosimulate (m1, [dObj1 dObj2]);
策划的结果。
sbioplot (sim1);
sbioplot (sim2);
sbioplot (sim3);
sbioplot (sim4);
加速模拟使用Configset和剂量对象
加载一个样本SimBiology项目。
sbioloadprojectradiodecay.sbproj
从模型中获取默认配置设置。
defaultConfigSet = getconfigset (m1,“默认”);
增加物种的数量x由100个分子在2秒通过添加剂量。
dObj = adddose (m1,“d1”,“安排”);dObj。数量= 100;dObj。AmountUnits =“分子”;dObj。TimeUnits =“第二”;dObj。时间= 2;dObj。TargetName =“unnamed.x”;
为加速模型模拟使用默认configset对象和添加剂量对象。
sbioaccelerate (m1, defaultConfigSet dObj);
模拟模型使用相同的configset和剂量对象。
sim = sbiosimulate (m1, defaultConfigSet dObj);
策划的结果。
sbioplot (sim);
加速模拟使用Configset、剂量和不同对象
加载一个样本SimBiology项目。
sbioloadprojectradiodecay.sbproj
添加一个新的配置设置使用一个不同的停止时间15秒。
csObj = m1.addconfigset (“newStopTimeConfigSet”);csObj。StopTime = 15;
增加物种的数量x由100个分子在2秒通过添加剂量。
dObj = adddose (m1,“d1”,“安排”);dObj。数量= 100;dObj。AmountUnits =“分子”;dObj。TimeUnits =“第二”;dObj。时间= 2;dObj。TargetName =“unnamed.x”;
添加一个变异的物种x使用不同的初始数量的500个分子。
vObj = addvariant (m1,“v1”);addcontent (vObj, {“物种”,“x”,“InitialAmount”500});
为加速模型模拟使用configset,剂量,和不同对象。在这种情况下,第三个参数sbioaccelerate对象必须是变体。
sbioaccelerate (m1, csObj vObj dObj);
使用相同的configset模拟模型,变体,和剂量对象。
sim = sbiosimulate (m1, csObj、vObj dObj);
策划的结果。
sbioplot (sim);
输入参数
版本历史
介绍了R2010a
