万博1manbetx支持的文件和数据类型
方法中导入表格数据SimBiology模型分析器app或MATLAB®工作区。支持的文万博1manbetx件类型为Excel®文件(.xls、.xlsx)、文本文件(.csv、.txt)、SAS文件®XPORT文件(.xpt)。还可以指定数据在NONMEM中®格式的文件。导入过程根据NONMEM定义解释列。有关更多信息,请参阅万博1manbetx支持导入NONMEM格式的文件.
请注意
如果数据集包含剂量信息,即注射数据,则数据集必须包含速率,而不是注射持续时间。
单位转换
无论单位转换功能是打开还是关闭,数据文件中的剂量都必须以量(或为/时间
输注速率)。默认情况下单位转换关闭,因此必须确保数据的单位彼此一致。如果要启用单位转换,请参见导入数据的单位转换.
创建数据文件SimBiology定义
如果您正在创建一个包含时间过程数据的文件,您希望将其导入SimBiology进行拟合,请使用以下列创建数据文件:
组列—指定文本、数字或类别值。例如,您可以使用此列将多个个人分组到单独的组中。然后可以将此分组或分类信息用于层次适合.这一列是可选的。
ID列—指定文本、数字或类别值。文件中具有相同ID列值的行是针对同一个人的。如果测量数据仅来自一个人,则此列是可选的。
时间列-在每个ID中单调地指定递增的正值,这些ID定义了剂量、观察测量和协变量测量的时间。
零个或多个给药柱-为每个隔间创建一个给药柱。在每一列中,指定代表添加到一个物种的剂量量的正数值。使用
南
(不是一个数字),以说明在指定的时间内没有使用剂量。换句话说,指定剂量为南
当有观察记录但没有使用剂量时。零或多个速率列—指定正值、零或
南
.0表示无限速率和南
指定不应用任何速率。速率列与给药列相关联,并定义给药的速率。例如,如果可以指定输注剂量Dose1
列中指定其速率Rate1
列。零个或多个观察列—指定数值或
南
.南
值定义在指定的时间内没有记录任何观测。使用南
当使用剂量但没有观察记录时。您可以为每个ID指定一个特定时间的观测值。当您有复制时,通过添加具有相同时间值的多行来为同一时间点指定多个观测值。例如,请参阅下面屏幕截图中的第2行和第3行,其中CentralConc在时间= 0时有两次测量值。零个或多个协变量列—指定文本、数字或类别值或
南
.每个值定义了特定时间的协变量值。南
数值表明在指定时间内没有记录协变量观测值。SimBiology只万博1manbetx支持非时变的协变量。例如,请参见性而且年龄列。有关显示如何使用类别进行拟合的示例,请参见为多个个体估计类别特定的PK参数.您还可以从协变量列创建变量。详细信息请参见createVariants
.
下面是示例数据文件的屏幕截图。
你可以从以下位置下载Excel样本文件:matlabroot/ / simbio /数据/ sample_data_simbiology.xlsx例子
.matlabroot是安装MATLAB的根目录。你也可以进入matlabroot
在命令行中查看根目录的文件路径。
万博1manbetx支持导入NONMEM格式的文件
您可以指定数据在一个NONMEM格式的文件中。下表强调了SimBiology中这些数据的解释®软件
列标题 | 解释 | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ID |
标识记录或组的文本(字符向量)、数字或分类值。导入过程假设具有相同值的连续数据包含来自一个个体的数据。如果数据包含对相同值的不连续引用,导入过程将为遇到的第二个ID分配一个从第一次遇到的组派生的索引值。例如,如果ID列包含 |
||||||||||
时间 |
每组内的正数值单调递增,表示观察时间或剂量或文本(字符向量)。数据文件可以指定时钟( 下表是导入过程如何将时钟值解释为十进制值的示例。
如果数据文件还包含 |
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日期 ,DAT1 ,DAT2 ,或DAT3 |
定义了观察的日期或剂量。该列可以包含以数字表示的月份(
请注意
|
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DV |
观测值的数值。列不能包含正 或负 . |
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形状 |
定义一行是否描述一个观察值:
|
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EVID |
定义记录中该行描述的事件类型:
如果一列包含剂量值,但是 如果 导入过程不支持值万博1manbetx |
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CMT |
指示用于观察值或接收剂量的隔间。解释也取决于EVID :
请注意 SimBiology以1开始为隔间编号,而NONMEM以0开始为隔间编号。例如,如果一个NONMEM数据文件包含的剂量和测量 |
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AMT |
正数表示剂量。0 或南 指定不给药剂量。列不能包含正 . |
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率 |
正数表示输注速率。0 指定无限速率(相当于一个丸剂剂量),和南 不指定速率。列不能包含正 . |
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2 |
正数定义两次剂量之间的时间。 | ||||||||||
ADDL |
当数据指定若干相同的连续剂量在特定的间隔(由2 ),ADDL 指定系列中不包括初始剂量的剂量数。如果数据指定了2 但不是ADDL ,则SimBiology假设在该数据记录的持续时间内发生给药。 |
不支万博1manbetx持的NONMEM定义
导入过程不支持(因此忽略)包含以下值或定义的行:万博1manbetx
EVID
值3和4党卫军
列,用于指定稳态剂量PCMT
列以定义是否为该行计算预测调用
列,用于调用ERROR或PK子例程如果rate被指定为小于零,则假定它为零
万博1manbetxSimBiology模型分析器支持的表列类型
从表导入数据时使用SimBiology模型分析器,应用程序支持以下列万博1manbetx数据类型:双
,字符
,字符串
,字符向量的单元格数组,分类
,持续时间
,逻辑
,datetime
.
万博1manbetx支持将多维SimData导入SimBiology模型分析器
当你导入一个多维SimData
数组放到应用程序中,应用程序会将SimData
数组,并在相应的数据表中使用单一索引(线性索引)。例如,如果您导入一个2 x2x2
SimData数组一个,该应用程序创建了一个包含8组(每个组一个)的数据表SimData
对象),索引从1到8。该应用程序仍然显示的原始大小SimData
数组中的浏览器.