日程(非线性和差分/代数方程式旋转套件)是开发的自由可用的第三方包装的一部分劳伦斯利弗莫尔国家实验室。所有其他ode求解器用于模拟偶像生物学®模型,如ODE45.
和ode15s.
,是matlab的一部分®颂套房。夏天学前(R2018B或更高版本)使用日期3.1.0。
Simbiology始终使用日期求解器对模型进行灵敏度分析,无论您选择的内容如何索尔弗蒂
在配置集中。
此外,如果您正在使用的估算模型参数SBIOfit.
或者具有这些基于梯度的估计函数之一的拟合数据程序:粉刺
那Fminunc.
那lsqnonlin
, 要么lsqcurvefit.
,Simbiology默认使用日光求解器来计算敏感性并使用它们来改善拟合。如果您正在使用SBIOfit.
,您可以通过设置来关闭此敏感性计算功能'敏感性分析'名称 - 值对参数错误的
。但是,如果您使用的是拟合数据程序,则无法关闭此功能。建议您在尽可能以更准确的梯度近似和更好的参数适合的情况下保持灵敏度分析功能。
当您指定时日星期日
对于求解器,该软件选择两个日常求解器,CVODE或IDA中的一个,适用于您的型号:
CVODE.是ODES系统的求解器,无论是非抗争和僵硬的。当模型没有代数规则时使用这一点。
偶像是差分代数方程(DAE)求解器,当存在一个或多个代数规则时使用。
有关日期求解器的更多信息,请参阅https://www.llnl.gov/casc/sundials/description/description.html.
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