主要内容

普罗克汝斯忒斯分析

比较具有里程碑意义的数据

普罗克汝斯忒斯函数使用Procrustes分析来分析一组形状的分布。这种分析方法匹配地标数据(在给定形状中代表重要特征的几何位置),以计算最佳的保持形状的欧几里德变换。这些转换最小化了比较地标数据之间的位置差异。

Procrustes分析在与多维标度结合时也很有用。在使用多维尺度构造地图有一个观察,重建点的方向是任意的。多维尺度的两种不同应用可以产生原则上非常相似的重构点,但由于它们有不同的方向,所以看起来不同。的普罗克汝斯忒斯函数转换一组点,使它们与另一组点更具可比性。

数据输入

普罗克汝斯忒斯函数以两个矩阵作为输入:

  • 目标形状矩阵X有尺寸n×p,在那里n地标的数量在形状和p是每个地标的测量数。

  • 比较形状矩阵Y有尺寸n×p.如果比较形状的每个地标的测量值少于目标形状(<p),函数将列0添加到Y,产生一个n×p矩阵。

得到变换后的形状的方程,Z,是

Z b Y T + c (1)

地点:

  • b是一个伸缩系数(b> 1)或收缩(b< 1)分。

  • T是正交旋转和反射矩阵。

  • c是一个每列都有常值的矩阵,用于移动点。

普罗克汝斯忒斯功能选择bT,c使目标形状之间的距离最小化X以及变换后的形状Z用最小二乘准则测量:

1 n j 1 p X j Z j 2

预处理数据以获得准确的结果

9、普劳斯的分析是恰当的当一切p测量尺寸有相似的尺度。分析将是不准确的,例如,如果列Z有不同的尺度:

  • 第一柱的单位是毫升,从2000到6000不等。

  • 第二列的测量温度从10摄氏度到25摄氏度不等。

  • 第三列的单位是公斤,从50到230不等。

在这种情况下,标准化你的变量:

  1. 每个变量减去样本均值。

  2. 将每个结果变量除以其样本标准差。

使用zscore函数来执行此标准化。

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