3次元ボリュームイメージ処理

3次元体積データに対するフィルター処理,セグメント化およびその他のイメージ処理演算の実行

3次元データセットで，ピクセル演算，局局所处イメージイメージをしします。

アプリ

ボリュームビューアー	ボリュームデータとラベル付きボリュームデータの表示
ボリュームの领域分享	3次元グレースケールまたはRGBボリュームイメージのセグメンテーション

関数

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ボリューム表示

`volshow.`	ボリュームの表示
`LabelVolshow.`	ラベル付きボリュームの表示
`sliceViewer`	イメージスライスの参照
`orthosliceViewer`	グレースケールボリュームまたはRGBボリュームの直交スライスの参照
`obliqueslice`	3次元ボリュームボリュームデータからからののスライスの

イメージのインポートと変換

`adaptthresh`	局所的な1次统计量を使适応的なイメージのしきいしきい
`dicomread`	DICOMイメージの読み取り
`dicomreadVolume`	DICOMイメージのセットからの4次元ボリュームの構築
`dicomContours`	DICOM-RT构造体セットからroiデータの抽出
`imbinarize`	しきいしきい致原理による2次元グレースケールイメージまたは3次元ボリュームの2値化
`niftiinfo`	niftiファイルからメタデータの読み取り
`niftiwrite`	NIfTIフォーマットを使用したファイルへのボリュームの書き込み
`niftiread`	NIfTIイメージの読み取り
`tiffreadVolume`	TIFFファイルからボリュームを読み取る

イメージ算術

`imabsdiff`	2つのイメージの差の絶対値
`imadd`	2つのイメージを追加または定数をイメージに追加
`imdivide`	あるイメージを別のイメージに除算,またはイメージを定数で除算
`immultiply`	2つのイメージの乗算,またはイメージと定数の乗算
`imsubtract`	イメージを他のイメージから減算する,またはイメージから定数を減算する

幾何学的変換とイメージレジストレーション

`affine3d`	3次元アフィン几何学的変换
`imcrop3`	3次元イメージのトリミング
`imref3d`	ワールド座標に対する3次元イメージの参照
`Imregister.`	強度ベースのイメージレジストレーション
`Imregdemons.`	2つの2次元イメージまたは3次元イメージを位置合わせさせる変位場の推定
`imresize3`	3次元ボリューム強度イメージのサイズ変更
`imrotate3.`	3次元ボリュームグレースケールイメージの回転
`imwarp`	イメージへの幾何学的変換の適用

イメージのフィルター処理と強調

`fibermetric`	イメージ内の細長い構造またはチューブ状構造の強調
`fspecial3`	事前定義型の3次元フィルターの作成
`histeq`	ヒストグラム均等化を使用したコントラストの強調
`imadjustn.`	N次元ボリュームイメージの強度値の調整
`imboxfilt3.`	3次元イメージの3次元ボックスフィルター処理
`imfilter`	多次元イメージのN次元フィルター処理
`imgaussfilt3`	3次元イメージの3次元ガウスフィルター処理
`imhistmatchn`	参照イメージのヒストグラムと一致させるためにN次元イメージのヒストグラムを調整
`imnoise`	イメージにノイズを付加
`integralBoxFilter3`	3次元積分イメージの3次元ボックスフィルター処理
`integralImage3`	3次元インテグラルイメージの計算
`Medfilt3.`	3次元のメディアンフィルター制剂

モルフォロジー

`bwareaopen`	バイナリイメージからの小さなオブジェクトの削除
`bwconncomp`	バイナリバイナリイメージ内のの连结をを
`bwmorph3`	バイナリボリュームのモルフォロジー演算
`bwskel`	すべてのオブジェクトを2次元のバイナリイメージまたは3次元のバイナリボリュームの線に縮小
`imbothat`	ボトムハットフィルター処理
`imclose`	イメージにモルフォロジークロージングを行う
`imdilate`	イメージの膨張
`imerode`	イメージの收缩
`imopen`	イメージのモルフォロジーオープニング
`imreconstruct`	モルフォロジー再構成
`imregionalmax`	局所的な最大値
`imregionalmin`	局所的な最小値
`imtophat`	トップハットフィルター制剂
`offsetstrel`	モルフォロジーオフセット构造化要素
`strel`	モルフォロジー構造化要素
`分水岭`	分水岭変換

イメージのセグメンテーション

`activecontour`	动的轮郭（蛇）领域拡张法を使し前景と背景のイメージのとへののセグメント
`bfscore`	イメージのセグメンテーションのための輪郭マッチングスコア
`骰子`	イメージイメージセグメンテーションのためためsørensen-dice类似度函数
`gradientweight`	イメージの勾配に基づいてイメージピクセルの重みを計算
`graydiffweight`	グレースケール强度の差に基因イメージピクセルの重み计算
`imsegfmm`	高速マーチング法を使用したバイナリイメージのセグメンテーション
`imsegkmeans3`	K-meansクラスタリングベースのボリュームセグメンテーション
`jaccard`	イメージセグメンテーションのためのjaccard类似度数
`superpixels3`	3次元イメージの3次元スーパーピクセルオーバーセグメンテーション

イメージ解析

`bwselect3`	バイナリボリュームのオブジェクトを選択
`Edge3.`	3次元強度ボリューム内のエッジの検出
`imgradient3`	3次元イメージの勾配の大きさと方向の検出
`imgradientxyz`	3次元イメージの方向勾配の検出
`imhist`	イメージデータのヒストグラム
`regionprops3`	3次元ボリュームイメージ領域のプロパティの計測

深層学習用のイメージ拡張

`randomPatchExtractionDatastore`	イメージまたはピクセルラベルイメージから2次元または3次元のランダムパッチを抽出するためのデータストア
`centerCropWindow3d`	直方体の中央トリミングウィンドウの作成
`randomCropWindow3d`	ランダムな直方体のトリミングウィンドウの作成
`randomAffine3d`	ランダムな3次元アフィン変換の作成
`affineOutputView`	ワーピングイメージの出力表示の作成

トピック

ボリュームの领域分类を使用したバイナリマスクの作作作作作者

この例では,ボリュームの领域分享アプリでボリュームをセグメント化する方法を説明します。

入力ボリューム强度イメージの3次元スーパーピクセルの计算

この例では3次元MRIデータをスーパーピクセルのグレースケール強度イメージに変換する方法を説明します。

ボリュームビューアーアプリを使用した3次元ボリュームデータの調査

ボリュームビューアーアプリを使用して,3次元ボリュームデータの直交断面を表示できます。レンダリングを調整してボリュームの構造を明らかにします。

ボリュームビューアーアプリを使用した3次元ラベル付きボリュームデータの調査

ボリュームビューアーアプリを使用して,3次元ラベル付きボリュームデータを表示できます。ボリュームとラベル付きボリュームを同時に表示して,不透明度とカラーマップを変更できます。

ボリュームの深层学习习向け向け前(深度学习工具箱)

ボリュームイメージとラベルデータを読み取り,3次元深層学習向けに前処理します。

注目の例

マルチモーダル3次元医用画像のレジストレーション

この例では,強度ベースの自動イメージレジストレーションを使用して,2つのボリュームイメージを位置合わせする方法を説明します。

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3次元胸部スキャンからの肺のセグメント化

この例では,動的輪郭(蛇)を使用して3次元セグメンテーションを実行する方法を説明します。ボリュームビューアーアプリを使用して結果を表示できます。

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深層学習を使用した脳腫瘍の3次元セグメンテーション

この例では3次元U-Netニューラルネットワークに学習させて,3次元医用画像から脳腫瘍のセマンティックセグメンテーションを実行する方法を説明します。この例では3次元U-Netネットワークに学習させる方法を示し,さらに事前学習済みのネットワークも示します。3次元セマンティックセグメンテーションには,以3.0计算能力上のCUDA対応NVIDIA GPU™を使用することを強く推奨します(并行计算工具箱™が必要)。

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