SimBiology
생물학적시스템모델링,시뮬레이션및분석
SimBiology®약/는약동학력학(PK / PD)및시스템생물학응용프로그램에중점을두고동적시스템을모델링,시뮬레이션및분석하는앱및프로그래밍툴을제공합니다。모델을작성하기위한블록다이어그램편집기를제공하거나MATLAB®언어를사용하여프로그래밍방식으로모델을빌드할수있습니다。SimBiology에는일반PK모델의라이브러리가포함되어있으며이를사용자지정하고생물학적메커니즘시스템모델과통합할수있습니다。
다양한모델탐색기술을통해세포경로에최적의투약일정및추정되는약제표적을파악할수있습니다。SimBiology는약제노출,약제효능,효소및대사물질수준의시간경과프로파일을시뮬레이션하기위해상미분방정식(ODE)과확률적솔버를사용합니다。매개변수스윕및민감도분석을사용하여시스템역학을조사하고실험을안내할수있습니다。단일개체또는개체군데이터를사용하여모델매개변수를추정할수도있습니다。
시작하기:
모델빌드
정량적시스템약리학(QSP),생리학기반약물동태학(PBPK)또는약동학/약력학(PK / PD)모델을종이에그리는것처럼구축합니다。
모델역학지정
끌어서놓기블록다이어그램편집기또는프로그래밍툴을사용하여QSP, PBPK또는PK / PD모델을빌드할수있습니다。用(系统生物学标记语言)파일에서기존모델을가져옵니다。
당뇨QSP모델의다이어그램보기입니다。
모델변형생성
모델변형을사용하여기본모델구성과다른일련의매개변수값또는초기조건을저장합니다。모델의여러사본을생성하지않고도가상환자,약제후보,대체시나리오및가상(假设)가설을쉽게시뮬레이션할수있습니다。
모델변형테이블입니다。
투약전략평가
투약전략을정의및평가합니다。다른모델종류를대상으로한투약일정을결합하여복합치료의이점을평가하고최적의투약전략을결정합니다。
솔버선택
MATLAB颂歌솔버,日晷솔버를비롯한사용가능한여러결정론적솔버중하나를선택하거나확률적시뮬레이션알고리즘(SSA)명시적Tau-leaping,암시적Tau-leaping을비롯한확률적솔버중하나를선택합니다。
시뮬레이션가속화
모델을컴파일된C코드로변환하여대규모모델또는蒙特卡罗시뮬레이션을가속화합니다。并行计算工具箱™를사용하여여러코어,클러스터또는클라우드컴퓨팅리소스에시뮬레이션을배포해성능을더욱향상시킵니다。
클러스터및클라우드로확장하여성능을향상시킵니다。
비구획분석
구획모델을가정하지않고약제농도의시간경과측정으로부터약제의약물동태학매개변수를계산합니다。희소또는일련의샘플링을사용하여단일또는다중투약에대한실험및시뮬레이션데이터둘다에서NCA를수행합니다。
선형및반대수척도로표시된농도-시간데이터에대한AUC계산입니다。
비선형회귀
지역및전역추정방법을사용하여매개변수를추정하고매개변수및모델예측에대한신뢰구간을계산합니다。각그룹을독립적으로맞추어그룹별추정을생성하거나모든그룹에동시에맞추어단일값세트를추정합니다。
2구획PK모델의高斯매개변수신뢰구간입니다。
비선형혼합효과기법(NLME)
확률적근사화예상치최대화(SAEM), 1차조건추정(FOCE), 1차추정(FO),선형혼합효과(LME)근사또는제한된LME근사의확률적근사를사용하여개체군데이터를맞추는NLME방법을사용합니다。
비선형혼합효과방법에대한진전상황그래프입니다。
내장작업및대화형탐색툴
내장분석을사용하여모델을분석합니다。슬라이더를사용하여모델결과에대한매개변수또는투여량일정의변동에따른효과를대화형으로탐색할수있습니다。
다양한매개변수값과투약일정의효과를보여주는작업편집기입니다。
사용자지정분석
SimBiology를MATLAB스크립트와함께프로그래밍방식으로사용하여분석을자동화하고사용자지정분석을생성할수있습니다。
최적의주입속도를식별하는데사용되는사용자지정알고리즘입니다。
SimBiology데스크탑을이용한앱생성
SimBiology데스크탑을사용하여클릭한번으로독립형모델탐색앱을생성합니다。
항종양괴사인자치료결과를보여주는SimBiology데스크탑으로생성된앱입니다。
사용자지정앱빌드
MATLAB앱빌드기능을사용하여사용자지정된독립형앱을생성합니다。
조합치료에대한시뮬레이션결과를보여주는사용자지정앱입니다。
관측값
시뮬레이션후계산(예:곡선아래면적(AUC)계산)등을수행하여시뮬레이션,데이터피팅또는전역감도분석을위한응답으로사용
전역감도분석(GSA)
Sobol인덱스를계산하고다중파라미터GSA를수행하여모델수량의변동이모델응답에미치는영향조사
기능과그에상응하는함수에대한자세한내용은릴리스정보를확인하여주십시오。
