主要内容gydF4y2Ba

DesignMatrix.gydF4y2Ba

班级:gydF4y2BaLinearMixedModelgydF4y2Ba

固定和随机效应设计矩阵gydF4y2Ba

描述gydF4y2Ba

例子gydF4y2Ba

DgydF4y2Ba= DesignMatrix(gydF4y2BaLME.gydF4y2Ba)gydF4y2Ba或gydF4y2BaDgydF4y2Ba= DesignMatrix(gydF4y2BaLME.gydF4y2Ba,gydF4y2Ba“固定”gydF4y2Ba)gydF4y2Ba返回线性混合效应模型的固定效应设计矩阵gydF4y2BaLME.gydF4y2Ba.gydF4y2Ba

例子gydF4y2Ba

DgydF4y2Ba= DesignMatrix(gydF4y2BaLME.gydF4y2Ba,gydF4y2Ba'随机的'gydF4y2Ba)gydF4y2Ba返回线性混合效应模型的随机效应设计矩阵gydF4y2BaLME.gydF4y2Ba.gydF4y2Ba

例子gydF4y2Ba

DSUB.gydF4y2Ba= DesignMatrix(gydF4y2BaLME.gydF4y2Ba,gydF4y2Ba'随机的'gydF4y2Ba,gydF4y2BagnumbersgydF4y2Ba)gydF4y2Ba返回线性混合效果模型的随机效应设计矩阵的子集gydF4y2BaLME.gydF4y2Ba对应于整数指示的分组变量gydF4y2BagnumbersgydF4y2Ba.gydF4y2Ba

例子gydF4y2Ba

[GydF4y2BaDSUB.gydF4y2Ba,gydF4y2BagnamesgydF4y2Ba] = DesignMatrix(gydF4y2BaLME.gydF4y2Ba,gydF4y2Ba'随机的'gydF4y2Ba,gydF4y2BagnumbersgydF4y2Ba)gydF4y2Ba另外还返回与整数对应的分组变量名gydF4y2BagnumbersgydF4y2Ba.gydF4y2Ba

输入参数gydF4y2Ba

展开全部gydF4y2Ba

线性混合效果模型,指定为agydF4y2BaLinearMixedModelgydF4y2Ba使用的对象gydF4y2Bafitlme.gydF4y2Ba或gydF4y2Bafitlmematrix.gydF4y2Ba.gydF4y2Ba

分组可变数字,指定为整数阵列,在其中gydF4y2BaRgydF4y2Ba是包含线性混合效应模型的分组变量的单元阵列的长度吗gydF4y2BaLME.gydF4y2Ba.gydF4y2Ba

例如,可以指定分组变量ggydF4y2Ba1gydF4y2BaggydF4y2Ba3.gydF4y2Ba和G.gydF4y2BargydF4y2Ba如下。gydF4y2Ba

例子:gydF4y2Ba[1,3,r]gydF4y2Ba

数据类型:gydF4y2Ba双倍的gydF4y2Ba|gydF4y2Ba单gydF4y2Ba

输出参数gydF4y2Ba

展开全部gydF4y2Ba

线性混合效应模型的设计矩阵gydF4y2BaLME.gydF4y2Ba以下列方式返回:gydF4y2Ba

  • 固定效果设计矩阵-gydF4y2BangydF4y2Ba-经过-gydF4y2BapgydF4y2Ba矩阵组成的固定效果设计gydF4y2BaLME.gydF4y2Ba, 在哪里gydF4y2BangydF4y2Ba是观察人数和gydF4y2BapgydF4y2Ba是固定效应项的数量。固定效应项的顺序gydF4y2BaDgydF4y2Ba中的项的顺序gydF4y2Ba系数gydF4y2Ba财产的gydF4y2BaLinearMixedModelgydF4y2Ba对象gydF4y2BaLME.gydF4y2Ba.gydF4y2Ba

  • 随机效应设计矩阵gydF4y2BangydF4y2Ba-经过-gydF4y2BakgydF4y2Ba矩阵,由随机效应设计矩阵组成gydF4y2BaLME.gydF4y2Ba.这里,gydF4y2BakgydF4y2Ba等于gydF4y2Ba长度(B)gydF4y2Ba, 在哪里gydF4y2BaBgydF4y2Ba线性混合效应模型的随机效应系数是向量吗gydF4y2BaLME.gydF4y2Ba.gydF4y2Ba

    如果gydF4y2BaLME.gydF4y2Ba有gydF4y2BaRgydF4y2Bag分组变量gydF4y2Ba1gydF4y2BaggydF4y2Ba2gydF4y2Ba、……gGydF4y2BaRgydF4y2Ba,水平gydF4y2Ba米gydF4y2Ba1gydF4y2Ba,gydF4y2Ba米gydF4y2Ba2gydF4y2Ba、……gydF4y2Ba米gydF4y2BaRgydF4y2Ba分别,如果gydF4y2Ba问gydF4y2Ba1gydF4y2Ba,gydF4y2Ba问gydF4y2Ba2gydF4y2Ba、……gydF4y2Ba问gydF4y2BaRgydF4y2Ba是与g相关的随机效应向量的长度吗gydF4y2Ba1gydF4y2BaggydF4y2Ba2gydF4y2Ba、……gGydF4y2BaRgydF4y2Ba然后分别gydF4y2BaBgydF4y2Ba是长度的柱矢量gydF4y2Ba问gydF4y2Ba1gydF4y2Ba*gydF4y2Ba米gydF4y2Ba1gydF4y2Ba+gydF4y2Ba问gydF4y2Ba2gydF4y2Ba*gydF4y2Ba米gydF4y2Ba2gydF4y2Ba+ ...... +gydF4y2Ba问gydF4y2BaRgydF4y2Ba*gydF4y2Ba米gydF4y2BaRgydF4y2Ba.gydF4y2Ba

    BgydF4y2Ba将各分组变量的每一级对应的随机效应向量的最佳线性无偏预测器串联为gydF4y2Ba[GgydF4y2Ba1gydF4y2Ba等级gydF4y2Ba1gydF4y2Ba;gGydF4y2Ba1gydF4y2Ba等级gydF4y2Ba2gydF4y2Ba;…;gGydF4y2Ba1gydF4y2Ba等级gydF4y2Ba米gydF4y2Ba1gydF4y2Ba;gGydF4y2Ba2gydF4y2Ba等级gydF4y2Ba1gydF4y2Ba;gGydF4y2Ba2gydF4y2Ba等级gydF4y2Ba2gydF4y2Ba;…;gGydF4y2Ba2gydF4y2Ba等级gydF4y2Ba米gydF4y2Ba2gydF4y2Ba;…;gGydF4y2BaRgydF4y2Ba等级gydF4y2Ba1gydF4y2Ba;gGydF4y2BaRgydF4y2Ba等级gydF4y2Ba2gydF4y2Ba;…;gGydF4y2BaRgydF4y2Ba等级gydF4y2Ba米gydF4y2BaRgydF4y2Ba]'gydF4y2Ba.gydF4y2Ba

数据类型:gydF4y2Ba单gydF4y2Ba|gydF4y2Ba双倍的gydF4y2Ba

随机效果设计矩阵对应于整数指示的分组变量的子矩gydF4y2BagnumbersgydF4y2Ba,返回一个gydF4y2BangydF4y2Ba-经过-gydF4y2BakgydF4y2Ba矩阵,gydF4y2BakgydF4y2Ba是柱矢量的长度gydF4y2BaBsubgydF4y2Ba.gydF4y2Ba

BsubgydF4y2Ba包含随机效应向量的串联最佳线性无偏预测因子(BLUPs),对应于分组变量的每一级,由gydF4y2BagnumbersgydF4y2Ba.gydF4y2Ba

例如,如果gydF4y2BagnumbersgydF4y2Ba是gydF4y2Ba[1,3,r]gydF4y2Ba,对应于分组变量ggydF4y2Ba1gydF4y2BaggydF4y2Ba3.gydF4y2Ba和G.gydF4y2BargydF4y2Ba.然后,gydF4y2BaBsubgydF4y2Ba包含对应于分组变量的每个级别的随机效应向量的连接结合gydF4y2Ba1gydF4y2BaggydF4y2Ba3.gydF4y2Ba和G.gydF4y2BargydF4y2Ba,如gydF4y2Ba

[GgydF4y2Ba1gydF4y2Ba等级gydF4y2Ba1gydF4y2Ba;gGydF4y2Ba1gydF4y2Ba等级gydF4y2Ba2gydF4y2Ba;…;gGydF4y2Ba1gydF4y2Ba等级gydF4y2Ba米gydF4y2Ba1gydF4y2Ba;gGydF4y2Ba3.gydF4y2Ba等级gydF4y2Ba1gydF4y2Ba;gGydF4y2Ba3.gydF4y2Ba等级gydF4y2Ba2gydF4y2Ba;…;gGydF4y2Ba3.gydF4y2Ba等级gydF4y2Ba米gydF4y2Ba3.gydF4y2Ba;gGydF4y2BargydF4y2Ba等级gydF4y2Ba1gydF4y2Ba;gGydF4y2BargydF4y2Ba等级gydF4y2Ba2gydF4y2Ba;…;gGydF4y2BargydF4y2Ba等级gydF4y2Ba米gydF4y2BargydF4y2Ba]'gydF4y2Ba.gydF4y2Ba

因此,gydF4y2BaDsub * BsubgydF4y2Ba表示分组变量g对应的所有随机效应的贡献gydF4y2Ba1gydF4y2BaggydF4y2Ba3.gydF4y2Ba和G.gydF4y2BargydF4y2Ba对…的反应gydF4y2BaLME.gydF4y2Ba.gydF4y2Ba

如果gydF4y2BagnumbersgydF4y2Ba是空的,然后gydF4y2BaDSUB.gydF4y2Ba是完全随机效果设计矩阵。gydF4y2Ba

数据类型:gydF4y2Ba单gydF4y2Ba|gydF4y2Ba双倍的gydF4y2Ba

对对应于整数的分组变量的名称gydF4y2BagnumbersgydF4y2Ba如果设计类型为gydF4y2Ba'随机的'gydF4y2Ba,返回为gydF4y2BakgydF4y2Ba- 1个单元阵列。如果设计类型是gydF4y2Ba“固定”gydF4y2Ba,然后gydF4y2BagnamesgydF4y2Ba是一个空矩阵gydF4y2Ba[]gydF4y2Ba.gydF4y2Ba

数据类型:gydF4y2Ba细胞gydF4y2Ba

例子gydF4y2Ba

展开全部gydF4y2Ba

加载样本数据。gydF4y2Ba

负载(gydF4y2Ba'shift.mat'gydF4y2Ba);gydF4y2Ba

数据显示了5名操作人员在早上、晚上和晚上三个不同班次生产的产品与目标质量特性的偏差。s manbetx 845这是一个随机的区块设计,其中的操作符就是区块。实验旨在研究换挡时间对换挡性能的影响。绩效衡量是质量特征与目标值的偏差。这是模拟数据。gydF4y2Ba

转变gydF4y2Ba和gydF4y2Ba操作符gydF4y2Ba是名义上的变量。gydF4y2Ba

shift.shift =名义(shift.shift);shift.Operator =名义(Shift.Operator);gydF4y2Ba

拟合一个线性混合效应模型与随机截距按算子分组,以评估性能是否根据移位的时间显著不同。gydF4y2Ba

lme = fitlme(shift,gydF4y2Ba'QCDev ~ Shift + (1|Operator)'gydF4y2Ba);gydF4y2Ba

显示固定效果的设计矩阵。gydF4y2Ba

DesignMatrix(LME)gydF4y2Ba
ans =.gydF4y2Ba15×3.gydF4y2Ba1 1 0 1 0 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 1 0 1 0 1 1 0 1 0 1 1 0 0⋮gydF4y2Ba

1S列表示模型中的常数项。gydF4y2Bafitlme.gydF4y2Ba作为参考组提出晚上的转变,并创建两个虚拟变量以分别代表早晨和夜班。gydF4y2Ba

显示随机效果设计矩阵。gydF4y2Ba

DesignMatrix(LME,gydF4y2Ba“随机”gydF4y2Ba)gydF4y2Ba
α=(1,1)1(2,1)1(3,1)1(4,2)1(5,2)1(6,2)1(7,3)1(8,3)1(9,3)1(10,4)1(11,4)1(12,4)1(13,5)1(14,5)1(15,5)1gydF4y2Ba

第一个数字,gydF4y2Ba我gydF4y2Ba,在…gydF4y2Ba我gydF4y2Ba,|j|)指标对应观测数,|j|对应分组变量水平,gydF4y2Ba操作符gydF4y2Ba,即运营商编号。gydF4y2Ba

显示随机效应设计矩阵的完整显示。gydF4y2Ba

全部(designMatrix (lme,gydF4y2Ba“随机”gydF4y2Ba)))gydF4y2Ba
ans =.gydF4y2Ba15×5gydF4y2Ba1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0⋮gydF4y2Ba

每列对应于分组变量的级别,gydF4y2Ba操作符gydF4y2Ba.gydF4y2Ba

加载样本数据。gydF4y2Ba

负载(gydF4y2Ba“fertilizer.mat”gydF4y2Ba);gydF4y2Ba

数据集阵列包括来自分裂绘图实验的数据,其中土壤基于土壤类型分为三个块:沙质,粉质和壤土。每个块分为五个地块,其中五种不同类型的番茄植物(樱桃,雷子,葡萄,藤和李子)随机分配给这些图。然后将图中的番茄植物分为凹陷,其中每种子舱由四种肥料中的一个处理。这是模拟数据。gydF4y2Ba

将数据存储在名为gydF4y2BadsgydF4y2Ba,实际目的,并定义gydF4y2Ba番茄gydF4y2Ba,gydF4y2Ba土壤gydF4y2Ba, 和gydF4y2Ba肥料gydF4y2Ba作为分类变量。gydF4y2Ba

ds =肥料;ds。番茄=名义(ds.Tomato);ds。土壤=名义(ds.Soil);ds。肥料=名义(ds.Fertilizer);gydF4y2Ba

拟合线性混合效应模型,其中gydF4y2Ba肥料gydF4y2Ba和gydF4y2Ba番茄gydF4y2Ba是固定效果变量,平均产量由块(土壤类型)变化,并且块内的块(土壤类型中的番茄类型)独立地变化。gydF4y2Ba

lme = fitlme(DS,gydF4y2Ba'产量〜肥料*番茄+(1 |土壤)+(1 |土壤:番茄)'gydF4y2Ba);gydF4y2Ba

存储并检查完整的随机效应设计矩阵。gydF4y2Ba

D =全(designMatrix (lme,gydF4y2Ba“随机”gydF4y2Ba));gydF4y2Ba

矩阵的前三列gydF4y2BaDgydF4y2Ba包含指标变量gydF4y2Bafitlme.gydF4y2Ba为三个级别创造(gydF4y2Ba懒散gydF4y2Ba,gydF4y2Ba淤泥gydF4y2Ba,gydF4y2Ba沙gydF4y2Ba的第一个分组变量,gydF4y2Ba土壤gydF4y2Ba.接下来的15列包含为第二个分组变量创建的指示变量,gydF4y2Ba番茄gydF4y2Ba嵌套在gydF4y2Ba土壤gydF4y2Ba.这些基本上是代表等级的虚拟变量的元素乘积s manbetx 845gydF4y2Ba土壤gydF4y2Ba(gydF4y2Ba懒散gydF4y2Ba,gydF4y2Ba淤泥gydF4y2Ba, 和gydF4y2Ba沙gydF4y2Ba分别和水平gydF4y2Ba番茄gydF4y2Ba(gydF4y2Ba樱桃gydF4y2Ba,gydF4y2Ba葡萄gydF4y2Ba,gydF4y2Ba雷子gydF4y2Ba,gydF4y2Ba李子gydF4y2Ba,gydF4y2Ba葡萄树gydF4y2Ba, 分别)。gydF4y2Ba

加载样本数据。gydF4y2Ba

负载(gydF4y2Ba“fertilizer.mat”gydF4y2Ba);gydF4y2Ba

数据集阵列包括来自分裂绘图实验的数据,其中土壤基于土壤类型分为三个块:沙质,粉质和壤土。每个块分为五个地块,其中五种不同类型的番茄植物(樱桃,雷子,葡萄,藤和李子)随机分配给这些图。然后将图中的番茄植物分为凹陷,其中每种子舱由四种肥料中的一个处理。这是模拟数据。gydF4y2Ba

将数据存储在名为gydF4y2BadsgydF4y2Ba,实际目的,并定义gydF4y2Ba番茄gydF4y2Ba,gydF4y2Ba土壤gydF4y2Ba, 和gydF4y2Ba肥料gydF4y2Ba作为分类变量。gydF4y2Ba

ds =肥料;ds。番茄=名义(ds.Tomato);ds。土壤=名义(ds.Soil);ds。肥料=名义(ds.Fertilizer);gydF4y2Ba

拟合线性混合效应模型,其中gydF4y2Ba肥料gydF4y2Ba和gydF4y2Ba番茄gydF4y2Ba是固定效果变量,平均产量由块(土壤类型)变化,并且块内的块(土壤类型中的番茄类型)独立地变化。gydF4y2Ba

lme = fitlme(DS,gydF4y2Ba'产量〜肥料*番茄+(1 |土壤)+(1 |土壤:番茄)'gydF4y2Ba);gydF4y2Ba

计算第二个分组变量的随机效应设计矩阵,并显示前12行。gydF4y2Ba

[Dsub, gname] = designMatrix (lme,gydF4y2Ba“随机”gydF4y2Ba,2);完整(DSUB(1:12,:))gydF4y2Ba
ans =.gydF4y2Ba12×15.gydF4y2Ba0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 00 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 00 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0⋮GydF4y2Ba

DSUB.gydF4y2Ba包含为第二个分组变量创建的虚拟变量,即嵌套在土壤下的番茄。这些是代表等级的虚拟变量的元素乘积s manbetx 845gydF4y2Ba土壤gydF4y2Ba(gydF4y2Ba懒散gydF4y2Ba,gydF4y2Ba淤泥gydF4y2Ba,gydF4y2Ba沙gydF4y2Ba分别和水平gydF4y2Ba番茄gydF4y2Ba(gydF4y2Ba樱桃gydF4y2Ba,gydF4y2Ba葡萄gydF4y2Ba,gydF4y2Ba雷子gydF4y2Ba,gydF4y2Ba李子gydF4y2Ba,gydF4y2Ba葡萄树gydF4y2Ba, 分别)。gydF4y2Ba

显示分组变量的名称。gydF4y2Ba

gnamegydF4y2Ba
gname =gydF4y2Ba1x1细胞阵列gydF4y2Ba{“土壤:番茄”}gydF4y2Ba

另请参阅gydF4y2Ba

|gydF4y2Ba|gydF4y2Ba