亲爱的Swarnambiga,
希望这不是太迟了(你正在寻找什么,我更成蛋白质…),但是我会试试看:
如果我理解正确使用Affymetrix数组数据,你想探头组ID映射到相应的基因。
存在一些示例代码如何这个任务的
关于探索微阵列基因表达数据文档
。在分段使用基因Onthology注释上调基因,有一些人类的数据解释你想做什么。他们提供相关的基因符号之间的地图去MAT-file id,而且还描述如何获得最新数据,particlar人类从去数据库设置注释如下:
去= geneont (“生活”,真正的);
HGann = goannotread (“gene_association.goa_human”,…
“方面”,“F”,“字段”,{“DB_Object_Symbol”,“GOid”});
HGmap = containers.Map ();
为i = 1:元素个数(HGann)
关键= HGann .DB_Object_Symbol;
如果isKey (HGmap键)
HGmap(关键)= [HGmap(键)HGann(我).GOid];
其他的
HGmap(关键)= HGann .GOid;
结束
结束
如果你调整代码的特定情况下,我认为你会得到你想要的。如果不是,请提供更多的信息关于你试过(你想要什么)。
