有很好的教程将获得的一些代码合并到一个自定义的任务Simbiology吗?

5视图(30天)
我想添加密度作为自定义任务,不知道从哪里开始创建这个——我假设一个自定义的任务,但我甚至找guid如何开始编写这段代码。
任何方向是有益的。

接受的答案

Fulden Buyukozturk
Fulden Buyukozturk 2019年6月4日
嗨,安德鲁,
您可以实现这一点,或自定义分析在一般情况下,在SimBiology通过创建一个自定义任务SimBiology桌面你建议或通过使用MATLAB脚本。我建议使用MATLAB脚本至少在最初阶段,因为它会更容易调试代码。
帮助从这里开始,您可以配置一个任务然后看看MATLAB / SimBiology代码SimBiology任务背后的原因。这可能会为您的自定义分析作为出发点。你可以看到代码通过点击任务代码- >视图代码在任何内置的任务在任务编辑器。请见下文。
Picture1.png
例如,运行一个简单的模拟、编程的工作流,您可以直接通过MATLAB运行脚本可能看起来像下面的(你可以运行这个例子也因为我使用运项目):
%从SimBiology项目称为AntibacterialPKPD负载模型
项目= sbioloadproject (“AntibacterialPKPD”,“m1”);
模型= project.m1
%得到模型仿真设置和停止时间设置为336
设置= getconfigset(模型);
设置。StopTime = 336;
%得到的剂量计划模型
剂量= getdose(模型,“500毫克tid”)
%与剂量模拟
simdata = sbiosimulate(模型、设置剂量);
%绘制所有国家
sbioplot (simdata)
实现获得具体地说,我建议你看一看 simfunction 哈密顿蒙特卡罗采样器 从统计和机器学习工具。
这有帮助吗?
Fulden

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