MATLAB的答案

我如何完成一个视觉预测检查Simbiology PopPK sbionlmefitsa吗

15的观点(30天)
安迪
安迪 2019年9月16日
评论道: 安迪2019年10月14日
嗨Simbiology团队:
我想完成一个视觉预测检查(VPC)使用sbionlmefitsa popPK后分析。我把这个Simbiology团队几年前和解释说,一般标准实践完成VPC后NLME人口药物动力学。
我想适应这个例子中,使用sbiofit sbionlmefitsa -非线性最小二乘回归,它不工作:
//www.tianjin-qmedu.com/help/simbio/ref/simbiology.fit.parameterconfidenceinterval.html
ci = sbioparameterci (fitResults)
ci_results = sbiopredictionci (ci);
图模型预测的置信区间
情节(ci_results)
我知道有一个SimFunction工具。有,我可以简单的出口Simbiology fitResults结果或结果。米做的VPC PopPK在Matlab Simbiology例子吗?
谢谢你！

在回答这个问题。

接受的答案

Sietse Braakman
Sietse Braakman 2019年9月23日
嗨,安迪,
请原谅晚回复。你看着使用吗 sbiosampleparameters 吗?您可以使用此函数样本协变量模型估计θ和贱民。协变量模型,估计θ和贱民都可以从你的混合提取影响健康结果( NLMEresults 对象)。此外,您将需要创建一个数据集,其中包含每个主题的解释变量,你想模拟。
一旦你有采样协变量模型估计θ和贱民,然后您可以使用一个simfunction模拟模型。我建议调用simfunction outputTimes向量代替stopTime,为了得到均匀的输出向量为每个模拟。这是一个计算百分位数,要求见下文。
一旦你有模拟样本,您可以使用 prctile 函数计算百分位数。可视化的百分位数,你可能想看看可视化方法,也许在MATLAB FileExchange 在这里 。
让我知道如果这回答了你的问题。
最好的,
Sietse
1评论
安迪
安迪 2019年9月30日
编辑:安迪 2019年10月2日
嗨Sietse,
谢谢你花时间来回答这个问题。我能够样本θ和欧米伽和完成了蒙特卡罗模拟生成VPC数据。然而,可视化部分是使用vpc的包在R是在这里找到: http://vpc.ronkeizer.com/
谢谢你的信息Sietse。
安迪

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答案(1)

Sietse Braakman
Sietse Braakman 2019年10月9日
嗨,安迪,
谢谢你的反馈。与一个万博1manbetx更具体的例子支持我的建议方法,我们写了一个函数(vpc.m)和驱动程序脚本(vpcDriver.m)生成VPC的阴谋。我们使用的模型和数据集包含在FileExchange帖子,这不是保存在loadme。垫文件。输出的一个示例如下所示。在这篇文章的代码。
请注意,您可能需要包括额外的功能如果您需要使用装箱,预测校正或想把一个误差模型。
最好的,
Sietse
VPC.png
1评论
安迪
安迪 2019年10月14日
嗨Sietse,
谢谢你花时间提供一个清晰的答案从我的上传Simbiology项目使用数据。
我重复PopPK配合,完成了视觉预测检查和它工作得很好。
这是一个更新图:
VPC_fit_ok.jpg
这是优秀的支持,我相信很多Matlab S万博1manbetximbiology用户将感激终于有视觉预测检查脚本。
杰出的,再次感谢。
安迪

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