模拟simfunctions和sbiofit停止标准

1视图(30天)
你好,
彼此相关的几个问题:
  1. “MaximumWallClock”属性(//www.tianjin-qmedu.com/help/simbio/ref/maximumwallclock.html)仅适用于“sbiosimulate”或simfunctions和“sbiofit”?
  2. 如果它适用于simfunctions,规范输出次simfunction覆盖的呼唤MaximumWallClock设置,建议是这样的“sbiosimulate”在上面的链接吗?
  3. 如果“MaximumWallClock”属性中使用“sbiofit”,什么是目标函数的值分配给一个失败的仿真吗?
谢谢你!
在床上

接受的答案

Sietse Braakman
Sietse Braakman 2019年11月8日
嗨,在床上,
有趣的问题,
  1. 是的,configset大部分设置都继承了活跃。最值得注意的例外是被记录的状态和敏感性,和停止时间/输出时间。所以,MaximumWallClock应该适用于所有模拟SimFunction和sbiofit模拟。
  2. 一如既往,模拟运行,直到任何停止的标准得到满足。所以没有否决”的概念。“如果一个模拟需要更长的时间比maximumWallClock时间,仿真结果返回任何输出次。
  3. Sbiofit检测模拟结束时正的早期,并返回一个目标函数值,以便优化器将拒绝这个条件为最佳。使用sbiofit maximumWallClock时间通常是一个好主意,以避免ODE求解器被困在难以置信的仿真结果。
最好的,
Sietse
2的评论
emjey
emjey 2020年2月25日
编辑:emjey 2020年2月25日
嗨Sietse,在床上,我有一个相关的问题。我在一个循环中运行许多模拟,想终止了模拟“MaximumWallClock”。有一个构建国旗模拟终止这样的方法吗?这样做的原因是,我需要丢弃这些结果,因为这将伪造的分析结果(全球)的敏感性。

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