均方位移（MSD）分析是胶体研究和生物物理学中常用的一种技术，用于确定随时间推移颗粒的位移模式。特别是，它可以帮助确定粒子是否：
-自由扩散；
-运输；
-在运动中受到约束和限制。
除此之外，它还可以导出运动参数的估计值，如扩散系数。

@msdanalyzer是一个MATLAB逐值类，有助于执行此类分析。用户提供了他测量的几个轨迹，该类可以导出有意义的量来确定运动模态。

@msdanalyzer可以处理不同时启动、长度不同、检测缺失（间隙：在一个或多个帧中检测不到粒子，然后重新出现）以及采样时间不相同的轨迹（粒子轨迹）。一旦您将曲目添加到类中，所有内容都是透明的。它提供了绘制和检查数据的工具，无论是单个粒子的数据，还是总体平均数量的数据。它有几种校正漂移的方法，漂移是分析中的主要误差源。校正后，可通过MSD曲线或速度自相关分析数据。包括MSD曲线的自动拟合（但它们要求您具有曲线拟合工具箱），允许导出运动类型及其特征。

其中包括一个相当长的教程和参考资料，将向您介绍使用数值模拟的问题，使您重现已发布的结果，并详细说明课堂工作。需要一些物理基础。

http://tinevez.github.io/msdanalyzer/

如果您在工作中使用此工具，我们恳请您引用创建此工具的以下文章：

纳丁·塔伦蒂诺、让·伊夫·蒂尼维斯、伊丽莎白·法里斯·克罗威尔、伯特兰·博伊松、里卡多·亨利克斯、穆萨·姆兰加、法布里斯·阿古、阿兰·伊斯雷尔和伊曼纽尔·拉普兰廷。TNF和IL-1在诱导NEMO-IKK超分子结构方面表现出不同的泛素需求。《细胞生物学》（2014）第204（2）卷第231-45页

http://jcb.rupress.org/content/204/2/231