Skeleton3D:平行内侧轴变薄的3 d二进制体积
这段代码计算任意的3 d中轴骨骼三维二进制体积。这是一个优化的MATLAB实现等位的稀疏算法[1]中描述。我们开发了量化网络在骨的细胞过程[2],但它应该工作在任何管状或丝状结构的图像。体积(testvol.mat)包含一个例子,连同一个例子脚本(Test_Skeleton3D.m)。任何评论,修正或建议是非常受欢迎的。
用法:
skel = Skeleton3D(本)
“本”是一个3 d二进制图像,和“skel”产生的图像仅包含骨架压,还是
面具skel = Skeleton3D(本)

面具前景像素点在“面具”从骨架化,如保护图像特定结构体积。

额外的清理,如修剪的短分支,请使用我Skel2Graph3D包在MATLAB文件交换。

这段代码是受ITK实现汉诺Homann[3]和斐济/ ImageJ插件Ignacio Arganda-Carreras [4]。如果你在您自己的工作中包括这个,请引用原来publicaton [2]。

菲利普Kollmannsberger 09/2013
philipk@gmx.net

引用:

[1]Ta-Chih Lee Rangasami l . Kashyap、Chong-Nam楚
“构建骨架模型通过3 d内侧表面/轴稀疏算法。”
计算机视觉、图形和图像处理、56(6):462 - 478年,1994年。

[2]Kollmannsberger, Kerschnitzki et al .,
“骨细胞的小世界:——lacuno-canalicular网络的骨头。”
新19:073019物理学报,2017。

[3]http://hdl.handle.net/1926/1292

[4]http://fiji.sc/wiki/index.php/Skeletonize3D