Biofilmq是一种先进的生物膜分析工具，用于量化在空间和时间内大的三维生物膜社区内的细胞的性质。它可以使用许多不同类型的3D生物膜图像，包括流量室生物膜，琼脂，颗粒和聚集体上的菌落。

BiofilmQ基于图形用户界面，不需要编程专业知识或图像分析的先验知识。

BiofilmQ有一个独特的方法来量化生物膜在空间和时间上的特性:BiofilmQ不需要单个细胞的光学分辨率。而BiofilmQ采用了一种不同的分割方法，它将基于阈值的3D分割得到的生物膜生物体积划分为立方体伪细胞。每个立方体被视为单个单元，对其荧光、建筑、空间和许多其他属性进行测量。通过使用这种基于立方体的方法，可以进行生物膜图像细胞计数(类似于流式细胞术，但具有空间特征)，这是基于许多伪细胞参数的量化。

BiofilmQ提供了强大的分析和绘图功能，用于显示来自每个伪单元立方体的数据。例如，可以生成生物膜的kymograph、人口统计图，并生成类似流式细胞术的数据集，包括种群门控，其中不仅包括细胞的荧光和结构特性，还包括生物膜内的空间特性。

易于使用的分析和可视化特性使您能够生成高质量的数据图，而无需任何编程技能。

对于具有编程专业知识的高级用户，所有特性都是完全可脚本化的(在MATLAB中)，用于批量处理大型数据集。