FitViruscv19功能实现了易受感染的(SIR)估计ePIDEMY评估的流行病模型。假设该模型是单阶段流行病的合理描述。特别是,该模型假设持续的群体,对人的均匀混合,同样可能被感染的群体。该模型是数据驱动的,因此其预测与数据一样好。预测与新的或更改数据的变化。官方宣布的疫情爆发和该计划报告的流行病爆发与彼此无关。该程序表示数据足以计算初始近似时的开始日期。
对于那些不熟悉流行模式的人,我们建议以下文章:https://en.wikipedia.org/wiki/Compartmental_models_in_epidemiolog那
http://www.maths.usyd.edu.au/u/marym/populations/hethcote.pdf.,https://web.stanford.edu/~jhj1/teachingdocs/jones-on-r0.pdf.。
通过最小化目标函数来获得模型的参数,这是值的值的平方和值的差值和值的平方和差异的平方和。Sumplands的权重自动选择。优化工具箱函数fminsearch用于计算未知模型参数的最佳值。如果计算失败,则只绘制数据。
贡献包含阿根廷,奥地利,比利时,巴西,加拿大,克罗地亚,中国,捷克共和国,丹麦,德国,匈牙利,法国,冰岛,印度,印度尼西亚,伊朗,意大利,日本,荷兰,挪威,波兰,葡萄牙,罗马尼亚,俄罗斯,斯洛伐克,塞尔维亚,斯洛文尼亚,韩国,西班牙,瑞士,土耳其,英国,美国和世界(最多28.april.2020)
在流行病评估图中,区域颜色将流行病阶段分开(这些阶段不是标准的,而是为了方便而任意选择的):
红-快增长阶段
黄色 - 过渡到稳态阶段
绿色结束阶段(高原阶段)
在总情况下,边距为+/- 3 * Rmse;在日常新案例图中,边距为+ / DRMSE。
在每日案例增长因子图中,只有两条线1%(绿色)和5%(红色)是出于方向性原因而显示的。
结果保存在结构res中(参见函数fiVirusCV19头)。可选的结果可以打印
fitVirusCV19 (@getDataXXX,“打印”,“上”)
其中XXX代表国家名称。当回归失败时,只绘制数据。人口规模限制在12 Mio。可以通过名称/值对修改上限:
fitVirusCV19 (@getDataXXX nmax, nmax)
如果最终预测过高或超过该国人口,则使用此选项。
从图中的图表中排除增长率(DEF值为3)
FitViruscv19(@ getDataxxx,'nsp',2)
函数分析secv绘制了一个评估联系人数(sigma)、Cend(疫情规模)、N(初始易感人群规模)的图表。分析XXX国疫情爆发后10天的数据
analyseCV19 (@getDataXXX, 10)
免责声明:软件和数据是用于教育,而不是用于医疗或商业用途。模型在某些情况下可能会失败。特别是,模型可能是不充分的;模型可能在初始阶段以及遇到其他流行病阶段或爆发(SIR模型没有描述)时失败。你可以自行决定使用它。
这些数据仅用于演示fitVirusCV19的操作。FitVirus和展示的演示数据仅用于教育和学术目的,不应用于医疗目的和商业。它们是按原样提供的,任何明示或默示保证,包括但不限于适销性和适用于特定目的的默示保证均不予承认。
数据来源
https://ourworldindata.org/coronavirus-source-data.。
https://www.worldometers.info/coronavirus/coronavirus-cases/#case-tot-outchina
https://en.wikipedia.org/wiki/2019%E2%80%9320_coronavirus_pandemic_by_country_and_territory
对应于getData函数中报告的每个国家的实际数据源。
NEW: importTotalCases函数从
更详细的描述可以在
https://www.researchgate.net/publication/339311383_Estimation_of_the_final_size_of_the_coronavirus_epidemic_by_the_SIR_model
例子可以在
https://www.researchgate.net/publication/339912313_Forecasting_of_final_COVID-19_epidemic_size_200318
引用作为
米兰巴蒂斯塔(2021)。fitviruscovid19(https://www.mathwands.com/matlabcentral/fileexchange/74658-fitviruscovid19),Matlab中央文件兑换。检索到。
MATLAB版本兼容性
平台兼容性
窗户 macOS Linux.标签
确认
启发:类Covid那fitVirusCV19varW (SIR模型变权拟合)那fitVirusCV19_state(美国COVID-19 SIR模型)那fitVirusCV19v3 (COVID-19 SIR模型)