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头脑风暴：开源应用于MEG / EEG数据分析
用于脑磁图和脑电图分析的MATLAB软件工具箱
让我们一起造大脑吧!
处理电生理数据的工具箱
基于有限元的简单工具基于电磁脑成像应用中的前向和逆模拟。
Deepsqueak V3：使用机器视觉加速生物处理研究
ExploreASL是一种标准化的、多中心的管道，用于动脉自旋标记灌注MR图像的图像处理和统计。
使用基于引导的显著性测试，对任何类型的数据进行单层和多层中介分析。
Jaaba：Janelia自动动物行为注释器
MNI2FS: MNI空间体高分辨率表面绘制
超极化MRI收购和重建方法的工具
NIfTI转换、可视化和转换工具
从客户端与飞轮API进行交互以获取搜索，获取，放置和计算。
一个用于读写NWB文件的Matlab接口。
运行Canlab Matlab工具箱所需的核心工具。这个工具箱的核心是支持交互分析的面向对象工具
用于读写CIFTI连接文件的MATLAB代码
在大规模钙成像数据中，多个阶段的细胞配准
用QMRLAB易于进行定量磁共振成像：使用GUI或CLI适合并模拟QMRI模型的无数。
Dynasim简化了动态系统建设和模拟模型的过程。
峰值提取工具
？一个轻量级的神经成像。nii到。png转换器为Matlab用户
CIAtah是一个用于单光子和双光子成像数据集钙成像分析的软件包。https://github.com/bahanonu/ciatah
快速创建出版物 - 质量图：自动颜色和小块，统计数据，小提琴/箱绘图等。
3D与roi工具的图象查看器matlab（Nifti Viewer，手动分段）
利用反向排列试验或移动窗函数对时间序列的平稳性进行了评价
使用spm1d软件包(v.0.4.3)，使用非参数方法(排列检验)，计算从anova1到anova3rm的方差分析和临时检验。
MATLAB Toolbox / Client for BlackFynn平台
绘制与分析神经科学数据库导向的研究应用
Matlab＆Bash脚本用于定位和交互可视化颅内电极数据
扩散MRI CSA-ODF计算的Matlab代码，Hough tracography，和连接分析。
单电极细胞外记录模拟器
用于与艾伦脑观测所交互的Matlab工具箱
基于听觉线索的恐惧条件反射的Matlab代码
MATLAB示例使用深度学习分类年龄从脑MRI图像
此代码使用前向Euler方法和MATLAB内置ODE求解器模拟IzhikeVich模型
基于休息状态或任务的神经影像数据的功能连接分析;Conn Toolbox，开发版
Anakyze尖峰列车从多电极阵列出口
此存储库包含Shubo Chakrabarti https://github.com/的日语版本的已发布的存储库“Live_script_spiking_neurons”
建立在关系数据库之上的科学工作流管理框架。
媒体浏览，分析和注释
卷积神经网络深度学习通过脑电图预测图像任务
PsychocoSics Toolbox版本3（PTB-3）是一套免费的Matlab和GNU倍频度功能，可用于视觉和神经科学研究。
识别立体图像中的三维结构
Xolotl：一个快速强大的神经元和网络模拟器
一种微型1光子钙成像信号提取管道。
CALCFD：计算3D结构的分形维数
用于运行神经生理实验和管理数据的Matlab工具箱
EEG脑电脑界面系统，用于提供实时演示夹带神经融合
一个黑盒子神经元，让学生们通过注入电流、添加药物和执行电压箝位操作来发现神经元是如何工作的。
神经信号与连续刺激相关的MATLAB程序包
免费和开源软件，用于分析脑成像数据序列
Sloan视力视力视图视图光学
基于matlab的尖峰排序的NEV文件
医疗软件处理多参数图像管道
EEG信号处理工具能够检测癫痫发作，绘图图形，谱图和计算功率。
从钙信号中提取尖刺（Deneux等，2016）
自然通信2018年出版的因果分解分析; 9：3378
仓库的实验与后院大脑硬件
变形贝叶斯分析（VBA）
这个函数提供了头部在'ch_list'给出的所需点上的地形图及其赋值。
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