数据集菜单
修改参数,比如立体像素大小和数据集的边界框,开始对齐工具,或做一些其他操作相关的数据集。
内容
对齐工具……
可用于对齐片打开数据集或对齐两个单独的数据集。看到细节在这里。
农作物数据集…
作物图像和相应的选择,面具,和模型层。种植可以通过互动、手动或使用ROI模式。
简短的演示可以在下面的视频:
https://youtu.be/PQtpYUuJwG8
当交互模式可以选择画(按下并保持鼠标左键)一个矩形区域的图像。这个区域可以用来种植。
种植的值也可以直接通过启用提供手册模式。也可以做裁剪的基础上选定的ROI。使用ROI面板让他们。
数据集可以裁剪(作物按钮)或复制到另一个缓冲和剪裁作物按钮)。多个缓冲区位于顶部的按钮按钮目录内容面板。
裁剪数据集可以放置回到原来的数据集使用融合到现有的模式的切图像工具可以在菜单- >文件- >切图像- >导入…。看到更多。
重新取样……
重新取样图像在任何可能的方向。
简短的演示可以在下面的视频:https://youtu.be/26-HROwg_JM
变换
转换的数据集:图像和所有其他层。下面的模式是有可能的
- 水平翻转翻转数据集从左到右,返回数据集与列翻转左右方向的,也就是说,垂直轴
- 垂直翻转——翻转数据集,返回数据集与行翻转上下方向的,也就是说,水平轴
- 翻转Z——次数据集在Z维度,与片翻转返回数据集上个方向,也就是说,中间的数据集
- 翻转Y——T维度,翻转数据集返回数据集与上个时间框架翻转的方向,也就是说,对一个中间帧的数据集
- 90度旋转——顺时针旋转数据集90度diirection
- -90度旋转——数据集90度旋转逆时针diirection
- 转置XY - > ZX——身体转置数据集,所以XY orienation,变成了ZX
- 转置XY - > ZY——身体转置数据集,所以XY orienation,变成了ZY
- 转置ZX - > ZY——身体转置数据集,所以ZX orienation,变成了ZY
- 转置Z- - - - - -T——身体转置数据集,所以Z orienation,变成了T
简短的演示可以在以下视频:
翻:https://youtu.be/lGjhB-NJZMk
旋转:https://youtu.be/WFbZn0rfb5I
置:https://youtu.be/PyEXX7j6pnc
片
数据集的操作与单个片。下面的行动是可能的
- 删除部分(s)……——删除所需的片从Z-stack (s)的数据集。例如,输入“5:10“删除所有从片5片10片。
- 删除帧(s)……——删除所需的框架(s)的时间序列数据集。
规模的酒吧
规模的酒吧是一个工具,它允许使用比例尺印在图像校准物理尺寸(X, Y) MIB的像素。
简短的演示可以在下面的视频:https://youtu.be/NZO0HG1d8ys
如何使用:
边界框……
边界框定义的位置在三维空间数据集;边界框信息重要的定位数据集的可视化软件,如阿米拉。边界框可以基于其最小或转移的中心坐标。边界框的当前坐标下所示当前的边界框文本。
注意!3 d图像的边界框计算的最小框包含所有体素中心,但并不是所有的像素点!即。体元定义的中心,这意味着半体元边界框的两边减去,导致一个边界框1小体素在所有三个方向。
简短的演示可以在下面的视频:https://youtu.be/lY0XjNy4Dr8
- X, Y, Z,分钟——定义了最小边界框的坐标
- X, Y,中心——定义了数据集的中心坐标。当使用中央坐标X,分钟和Y,分钟会重新计算坐标。
- * X, Y, Z马克斯——最大的边界框值。当进入的X, Y, Z分钟坐标- MIB重新计算体素的大小。
- 舞台上旋转偏差,度——实现只有当输入X, Y坐标中心。允许重新计算坐标的情况下,舞台上有一些旋转偏见,例如,Gatan 3视图45度阶段的偏见。
- 从剪贴板进口系统中,解析文本剪贴板并自动提取以下参数(语法:[ParameterName] = [ParameterValue]):
| 参数名称 | 描述 |
| ScaleX | 像素的物理尺寸X |
| 写入ScaleY | 像素的物理尺寸Y |
| ScaleZ | 像素的物理尺寸Z |
| xPos | 数据集的中心位置在X飞机 |
| yPos | 数据集的中心位置在Y平面 |
| Z位置 | 最小的Z坐标 |
| 旋转 | 旋转的偏见 注意! 因为它是专为Gatan 3视图系统MIB增加45度旋转检测到的值 |
文本的例子,可以复制到系统剪贴板的自动检测的目的:
参数
修改数据集的参数:压大小、帧速率为电影和单位。输入的新边界框的体素导致重新计算。
