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吉姆·博斯


克莱蒙特,博斯利有限责任公司

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Simbiology在使用“duplicate”时复制SBML id令牌
御马,谢谢!为了提醒大家这里的用例,如果有人在Simbiology中创建了一个模型,并在graphica上使用复制/粘贴…

27天前| 0

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Simbiology在使用“duplicate”时复制SBML id令牌
不确定这是否是有意的,但我相信它确实突出了一个bug。假设我在模拟生物学中创建一个模型,物种a和…

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SBML导出似乎没有导出修饰符
在SBML标准的描述中,即Hucka等人,系统生物学标记语言(SBML):语言规范f…

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放宽物种单位限制有何进展?
在SimBiology中,一个案例使用的单元是有限的。量,或浓度。这通常是不方便的,如(for ex…)

7个月前| 1回答| 0

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Matlab无法安装R2021b:在Ubuntu 20.04中“无法写入所选文件夹”
更多的细节——感谢Philip(见上文)的回答。显然,在终端窗口中,你必须运行xhost +SI:localu…

7个月前|

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Matlab无法安装R2021b:在Ubuntu 20.04中“无法写入所选文件夹”
试图在系统驱动器上安装R2021b。使用Ubuntu 20.04。可用384 Gb。我下载了matlab_R2020b_glnxa64.zip

8个月前| 1回答| 1

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有什么方法出口simbiology模型图在高分辨率?
我有一个相当大和复杂的模拟生物模型。我想在演示文稿中导出图形模型图。

8个月前| 1回答| 0

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什么时候sbmlimport将支持sbml万博1manbetx级别3?
知道会很有用。我相信2020b只支持2级,对吗?万博1manbetx还有人需要使用sblm级别吗?

1年前| 1回答| 0

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SimBiology物种名称中的分号:只是字符,还是功能活跃?
我看到了Sven Mesecke在Lo等人2011年的肾素血管紧张素醛固酮系统模型的应用。(对于那些……

2年前| 1回答| 0

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加载SimBiology()和sbioloadproject的模型之间的模拟速度有什么差异?
问题就在标题里。我没有看到在sbioloadpr打开的相同模型之间的数值效率有多大差异…

2年前| 1回答| 0

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命名空间和其他html / xml信息
Simbiology笔记允许(要求?)用户使用html格式的笔记。对于正常的文档使用,有…

2年前| 1回答| 0

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常量参数设置抛出错误,或者…如果我不把一个参数设为常数,但不改变它,它会保持不变吗?
在另一个线程中,我问了关于使用subject- (group- In SimBiology)依赖的参数值来允许拟合一个部分…

2年前| 1回答| 0

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固定SimBiology(R)图形的图标
关于最后一点,我发现:Simbiology / Preferences / Indicators Show indicator when a…

3年前| 0

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固定SimBiology(R)图形的图标
当图形化地使用仪表板构建模型时,可以固定图形元素。这可以防止不经意间把c…

3年前| 1回答| 0

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使用变量数组句柄删除或删除变量会产生意外的结果。
如果我有一个包含SimBiology参数对象的变量,并且我更改了它,该对象将反映该更改:par1 = addp…

3年前| 1回答| 0

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我能强迫Matlab等到它完成一个命令再运行另一个吗?
我有一个脚本,它使用SimBiology()命令加载SimBiology模型。然后我试着找到simbiol模型的手柄……

3年前| 1回答| 0

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是否可能在sbiofit中获得组(即主题)编号以进行查找?
最后一件事。我用这个组来设置参数。工作很好。重复赋值规则就是pv = setparvalu(。

3年前| 0

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sbifitmixed / nlmefit和加权两个因变量
我正拟合一个试验与两个输出测量(目前)。这是CONC1和CONC2。假设他们有非常不同的…

3年前| 0回答| 0

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是否可能在sbiofit中获得组(即主题)编号以进行查找?
Jérémy如果这些想法有帮助,我很高兴。我喜欢与您、Arthur、Pax以及您团队中的其他人的互动。我只是想澄清…

3年前| 0

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我怎么能在使用sbiofit后只绘制一个拟合变量?
我在为数据集拟合一个模型。我同时拟合了两个变量:治疗方法和内源性细胞的数量……

3年前| 2回答| 0

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是否可能在sbiofit中获得组(即主题)编号以进行查找?
如果我使用lsqnonlin拟合,是否有一个返回组号的matlab脚本函数?这个想法是允许使用co…

3年前| 3回答| 0

3.

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拟合时间小于零的多个因变量
假设我有一个治疗性的d,调节内源性物质e。我有一个pd模型的e(为了论证,一个缺点…

3年前| 1回答| 0

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画出来的东西的顺序vs传说的顺序
我用patch在matlab图中用彩色区域表示置信区间。假设时间值、tv和平均值的向量…

3年前| 1回答| 0

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在simbiology桌面中是否存在与模拟任务相关联的对象,该对象包含任务的名称?
在simbiology模拟任务中,我经常使用“plot to Generate”中的state_subplot。“生成的情节”允许脚本使用…

3年前| 1回答| 0

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如何清除Java堆空间内存????
乔纳森写道:“朋友们,这么多年过去了。喂?Mathworks请解决这个问题。”我在想也许8年…

3年前| 0

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popPK模型中协变量的nlme拟合误差
我在数据集中选择一个列(WT)作为协变量。当我在nlme拟合页面中设置协变量时(交互的,不是…

3年前| 1回答| 0

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我可以创建一个变量,捕捉所有当前参数,物种和隔间值?
所以我希望能够这样做:sbr = sbioroot;获取根对象lastn = length(sbr.m…)

4年前| 1回答| 0

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没有找到变量对象数组的信息

4年前| 1回答| 0

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更好地理解所寻求的变量(也包括项目文件)
如果我使用仪表板创建一个模型,包括变量(假设2,'var1'和'var2'),并保存模型,变量是……

4年前| 1回答| 0

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Simbiology模拟是否具有预加载功能?
在Si万博1manbetxmulink中,可以编写在打开模型或任意数量的其他操作时运行的预加载脚本。在Simbiology…

4年前| 1回答| 0

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