什么是Simbiology?
Simbiology®提供用于建模,模拟和分析动态系统的应用程序和程序化工具,重点关注定量系统药理学(QSP),基于生理的药代动力学(PBPK)和药代动力学/药态(PK/PD)应用。您可以使用SimBiology框图编辑器或使用MATLAB进行编程性构建模型®语言。您的模型可以从头开始创建,以SBML格式化文件导入,也可以基于SimBiology提供的模型示例构建。
Simbiology提供了多种技术,用于分析基于ODE的模型,这些模型的复杂性和大小范围。您可以运行模拟以评估目标可行性,预测药物疗效和安全性,并确定最佳剂量时间表。您可以使用局部和全局灵敏度分析来识别关键途径和参数,并通过运行参数扫描评估生物学变异性。为了估计参数,您可以使用非线性回归和非线性混合效应技术拟合数据并执行非室内分析(NCA)。
您可以使用Simbiology对生物系统和药物学进行建模,模拟和分析。它提供点和点击应用程序,以及用于QSP,PBPK和PK/PD应用程序的程序化工具,以加速药物发现和开发。
您可以使用SimBiology框图编辑器进行交互方式构建模型 - 或使用MATLAB进行编程®语言。要使用该图,只需连接代表系统组件(例如反应和物种)的块,并定义反应速率。Simbiology将自动从图表表示。
构建模型时,请将您最熟悉的单元用于任何给定的组件。运行计算时,单位转换将自动将所有数量转换为一致的单位系统。
Simbiology提供了多种方法,用于分析许多复杂性和大小的基于ODE的模型。运行模拟以评估目标可行性,预测药物疗效和安全性,并确定最佳的给药时间表。
使用滑块来互动探索参数变化对模型结果的影响。
通过蒙特卡洛模拟评估生物学变异性,通过从分布中抽样参数值。
通过自动将模型转换为编译代码来加快模拟加速模拟
使用灵敏度分析来识别关键途径和模型参数。使用全局灵敏度分析来了解哪些输入驱动模型响应跨参数空间,这可以有助于告知参数估计策略。
SimBiology允许您使用本地和全局优化方法拟合实验时间课程数据来估计模型参数。您也可以计算置信区间;该示例估计茶碱的药代动力学参数。
通过MATLAB脚本编程使用SimBiology来自动进行分析并超越内置工具。
许多分析可以使用并行计算工具箱更快地运行。您可以在多个内核,簇和云资源上分发仿真。
通过将SimBiology模拟作为Web应用程序分配,与合作者共享建模见解。合作者可以使用浏览器访问和运行Web应用程序,而无需安装任何软件。
要开始,请查看下面的链接或下载Simbiology的免费试用。
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