三菱Tanabe药房开发数据分析工具加速发现
挑战
求解
结果
- 算法开发快四倍
- 同声分析多药启动量,分析时间削减75%
- 部署工作量减少83%
算法开发MATLAB并应用 MathWorks咨询师帮助,使我们能够获取量化分析结果,避免人为错误,更有效地协作,可靠复制结果并翻倍每年完成可行性研究
对制药公司而言,动物生物研究,包括药代和药代学、药理学和毒理学研究,提供一些分步检查点,然后有前途的铅化合物开始人体临床测试并最终提交规范文件开发生物数据分析工具的数据科学家与使用这些工具提高药物发现研发生产率的板块生物学家和化学家之间往往存在差距。
三菱Tanabe Pharma与 MathWorks咨询服务公司合作,以弥补这一漏洞并提高药物候选者选择效率公司开发MATLAB®基础生物数据分析工具缩短分析算法的迭代性,提高生物学家效率,使他们能够评价更多药选人并加速发现过程
MATLAB开发工具, 生物学家可自动获取量化结果, 可靠复制和管理结果, 并比较多药效果,并实现每年完成的可行性研究数翻番
挑战
三联Tanabe Pharma试图提高药商选择水平,通常三联Tanabe药厂在实验动物研究获取数据后分两步分析
第一步,有写代码经验的数据科学家开发图像处理算法和数据处理子集数据算法数据科学家用Java写算法®Perl,R和Python,但此过程有几个缺陷第一,它耗时多,因为科学家常从头写代码,即使是已知图像处理技术第二,他们难读文件各种格式的数据第三,生物学家常发现算法难以使用,需要多迭以完善并部署易用版本
第二步 轮廓生物学家使用算法 分析和评价原创数据集案例生物学家过去的工作量包括人工任务,如将结果复制到电子表格中,管理文件夹,为特定图像群创建文件,识别高量图像文件分析区分析结果并非总能复制
公司力求提高这一过程两个步骤的效率
求解
三菱Tanabe Pharma开发生物数据分析算法使用MATLAB、图像处理工具箱TM、生物信息工具箱TM和统计机学习工具箱TM并协同 MathWorks咨询师使用MATLAB编译TM应用算法
数据科学家在MATLAB工具箱中工作,开发图像分割算法、视频对象跟踪和数据匹配算法工具箱调用函数从标准文件格式读预处理图像、视频和基因组数据并执行曲线平滑、噪声减慢、峰值检测、形态操作、图像量化和其他操作
团队优化算法,用样本数据和各种参数测试算法
数据科学家团队精练测试算法后,与 MathWorks咨询师合作,将算法整合成一组图形应用中,供轮班科学家用于诊断内部器官中的疾病、行为模式分析以及基因表达分析
团队使用MATLAB编译器创建独立可执行版这些应用可供生物学家使用,甚至是不运行MATLAB的生物学家使用
座谈生物学家使用这些应用评价图像和数据样本子集并使用各种参数值和算法选项确定最佳组合和选项后,使用应用分析全数据集
MATLAB基础工具应用与 MathWorks咨询服务开发
结果
算法开发快四倍.C/C++或JaMATLAB以内置函数、交互环境及整合多数据格式能力使开发速度提高四倍
同声分析多药启动量,分析时间削减75%.使用交互分析工具与MATLAB搭建和 MathWorks咨询师帮助,现在,我们可以评估多药效果并同时比较
部署工作量减少83%.MathWorks咨询师开发应用,供生物学家使用 算法,我们在MATLAB中创建算法, 将全时等效工作量减少83%,Saito注解咨询师与数据科学家和生物学家密切合作理解我们的需求,并比我们自己快快得多地完成项目
