计算敏感性
确定哪些模型组件对特定条件或药物敏感
功能
sbioelementarypects |
通过计算基本效果执行全局灵敏度分析(GSA)(需要统计和机器学习工具箱) |
SBIOSOBOL |
通过计算第一和总订单索博指数来执行全局灵敏度分析(需要统计和机器学习工具箱) |
Sbiompgsa |
执行多参数全局灵敏度分析(需要统计和机器学习工具箱) |
sbiosimulate |
模拟Simbiology模型 |
sbioaccelerate |
为加速模拟准备模型对象 |
创建功能 |
创建Simfunction对象 |
Sbiosample参数 |
通过采样协变量模型生成参数(需要统计和机器学习工具箱软件) |
sbiosampleRror |
基于错误模型的示例错误,并将噪声添加到仿真数据中 |
addConfigset |
创建配置集对象并添加到模型对象 |
getConfigset |
从模型对象获取配置集对象 |
getSensmatrix(simdata) |
从中获取3-D灵敏度矩阵Simdata 目的 |
对象
simbiology.gsa.gsa |
包含根据全球灵敏度分析(GSA)计算基本效应的结果的对象 |
simbiology.gsa.sobol |
包含第一和总订单索伯指数的对象 |
simbiology.gsa.mpgsa |
包含多参数全局灵敏度分析(MPGSA)结果的对象结果 |
敏感性分析 |
指定灵敏度分析选项 |
Simdata |
仿真数据 |
配置集 |
模型仿真的求解器设置信息 |
求解 |
指定模型求解器选项 |
RuntimeOptions |
记录物种的选项 |
编译 |
维度分析和单位转换选项 |
函数 |
执行Simbiology模型的类似功能的接口 |
类似函数 |
simunfunctionsenitivitivitive对象,子类函数 目的 |
方案 |
仿真方案 |
应用
Simbiology Model Builder | 构建QSP,PK/PD和机械系统生物学模型 |
Simbiology模型分析仪 | 分析QSP,PK/PD和机械系统生物学模型 |
示例以及如何
应用程序工作流程
- 使用SimBiology模型分析仪应用程序找到具有局部灵敏度分析的重要参数
执行灵敏度分析以找到重要的模型参数。
程序化工作流程
- 使用sbiosimulation计算敏感性
该示例使用酵母异三聚体G蛋白周期模型中描述的模型来说明Simbiology®灵敏度分析选项。
概念
- simbiology中的灵敏度分析
敏感性分析使您可以探索模型数量(物种,隔室和参数)对模型响应的变化的影响。
- 模型仿真
使用各种求解器模拟动态模型。
- 加速模型模拟和分析
通过将模型转换为编译C代码来加速模拟或分析。