SimBiology模型构建器

构建QSP、PK / PD和机械系统生物学模型交互

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描述

的SimBiology模型构建器应用程序允许您构建模型的动态系统,如定量系统药理学(QSP)模型,药代动力学/药效学(PK / PD)模型,和系统生物学模型交互。它提供了一个方块图编辑器来构建模型通过使用内置块反应示意图。

使用这个应用程序,您可以:

建立各种各样的动态系统,如代谢网络,信号通路,QSP模型,PBPK模型和PK / PD模型。
从内置库创建标准的区划的PK模型。
查看模型或图形表示的数学方程。
使用变量来存储一组参数值或初始条件不同的基本模型配置。
创建一个数组剂量探索不同的给药方案。
导入或导出SimBiology模型的MATLAB^®工作区或从系统生物学标记语言(用)文件。

打开SimBiology模型构建器应用程序

MATLAB将来发布:应用程序选项卡,在计算生物学,点击应用程序图标。
MATLAB命令提示:输入simBiologyModelBuilder。

例子

编程使用

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`simBiologyModelBuilder`

simBiologyModelBuilder打开应用程序。

`simBiologyModelBuilder (m1)`

simBiologyModelBuilder (m1)打开SimBiology模型m1在SimBiology模型构建器如果你也有应用。SimBiology模型分析应用程序开放的同时,这两个应用程序共享相同的模型。

如果SimBiology模型构建器或SimBiology模型分析应用程序已经打开,你不能加载模型从命令行或项目。直接从应用程序加载模型。

`simBiologyModelBuilder (prjFile)`

simBiologyModelBuilder (prjFile)打开项目文件prjFile在SimBiology模型构建器应用程序。prjFile是一个字符串或字符向量指定一个文件名或路径和文件名SimBiology项目SBPROJ文件。如果只指定一个文件名,文件必须在MATLAB搜索路径或在当前文件夹。如果你也有SimBiology模型分析应用程序开放的同时,这两个应用程序共享相同的项目。

如果SimBiology模型构建器或SimBiology模型分析应用程序已经打开,你不能加载模型从命令行或项目。直接从应用程序加载模型。