主要内容

SimBiology应用程序

交互式应用程序,便于构建、模拟和分析动态系统

SimBiology提供了一套集成应用程序,旨在帮助构建、模拟和分析动态系统的模型,如定量系统药理学(QSP)、药代动力学/药效学(PK/PD)和系统生物学模型。

  • 这个SimBiology模型生成器应用程序允许您使用各种建模元素以交互方式构建动态模型。例如,您可以对多种生物系统进行建模,如信号通路、代谢网络、PBPK、QSP和PK/PD模型。它还允许您模拟生物变异性和不同的给药方案,以调查各种实验条件和给药策略。

  • 这个SimBiology模型分析器应用程序允许您对动态系统的模型执行分析。可以使用各种解算器模拟模型的动态行为,并估计模型参数。为了研究系统动力学和指导实验,您可以执行灵敏度分析和参数扫描。

应用程序

SimBiology模型生成器 交互构建QSP、PK/PD和机械系统生物学模型
SimBiology模型分析器 分析QSP、PK/PD和机械系统生物学模型

功能

simbio.diagram.getBlock 获取SimBiology图块属性
simbio.diagram.setBlock 设置图表块属性
simbio.diagram.getLine 获取SimBiology图表行属性
simbio.diagram.setLine 设置图表行属性
simbio.diagram.splitBlock 在方框图中拆分SimBiology
simbio.diagram.joinBlock 将SimBiology物种块的所有副本合并到图中

话题

建立模型

受体-配体动力学模型的建立

此示例演示如何使用SimBiology模型生成器SimBiology模型分析器应用程序。

使用SimBiology Model Builder将SGLT2抑制纳入基于生理学的葡萄糖-胰岛素模型

将假设化合物对钠-葡萄糖共转运蛋白2(SGLT2)受体的抑制作用纳入现有的葡萄糖-胰岛素模型。

复制SimBiology块

在图中构建模型时复制和粘贴SimBiology块。

SimBiology模型组件库

模拟生物学®库是内置组件的集合,可用于构建和分析模型。

SimBiology模型生成器中的消息指示器图标

这个SimBiology模型生成器应用程序使用上下文图标提供有关浏览器表中的模型组件和中的块的更多信息简图标签。

SimBiology中的撤消和重做模型更改

可以撤消和重做与模型构建和配置块特性相关的操作。

SimBiology模型生成器的键盘快捷键

这个SimBiology模型生成器该应用程序为各种建模操作提供键盘快捷键。

生成SimBiology模型报告

生成包含模型信息的报告。

分析模型和数据

使用SimBiology Model Analyzer应用程序计算NCA参数并将模型拟合到PK/PD数据

进行非部分分析,并通过非线性回归拟合实验PKPD数据来校准模型参数。

使用SimBiology Model Analyzer应用程序进行灵敏度分析,找出重要参数

进行敏感性分析,以找到重要的模型参数。

使用SimBiology Model Analyzer应用程序对虚拟患者的生物变异性进行建模

为模型参数生成样本值以表示虚拟患者,并进行模拟以探索模型的可变性。

使用SimBiology Model Analyzer应用程序扫描给药方案

探索满足疗效和毒性阈值的多种剂量。

SimBiology模型分析器的键盘快捷键

这个SimBiology模型分析器应用程序为各种分析操作提供键盘快捷键。

为SimBiology项目结果生成报告

生成包含程序分析结果的报告。

百分位图

使用百分位图可视化实验数据和模拟统计数据。